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Please use this identifier to cite or link to this item: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/10809

Title: Identificação de infecções simples e mistas de estirpes de Potato virus Y (PVY) em campos produtores de batata
Other Titles: Identification of single and mixed infections of strains of Potato virus Y (PVY) in potato production fields
???metadata.dc.creator???: Alves, Mirelly Caroline
???metadata.dc.creator.Lattes???: http://lattes.cnpq.br/6630568211061083
???metadata.dc.contributor.advisor1???: Figueira, Antônia dos Reis
???metadata.dc.contributor.advisor-co1???: Galvino-Costa, Suellen B. F.
???metadata.dc.contributor.referee1???: Galvino-Costa , Suellen B. F.
???metadata.dc.contributor.referee2???: Martínez, Douglas Rodríguez
Keywords: DAS e TAS-ELISA
RT-PCR multiplex
Potyvirus
PVY
RT-qPCR
Multiplex polymerase chain reaction
Potato virus Y
???metadata.dc.date.submitted???: 5-Aug-2015
Issue Date: 27-Jan-2016
???metadata.dc.description.sponsorship???: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Citation: ALVES, M. C. Identificação de infecções simples e mistas de estirpes de Potato virus Y (PVY) em campos produtores de batata. 2016. 88 p. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2015.
???metadata.dc.description.resumo???: O Potato virus Y (PVY) é considerado o principal vírus com importância econômica para a bataticultura no Brasil. Um dos fatores responsáveis pelo aumento da diversidade de PVY são as infecções mistas de estirpes, que durante o processo de replicação viral podem gerar recombinantes mais bem adaptados às condições ambientais, com propriedades biológica, sorológicas e moleculares diversificadas. Neste trabalho, foram analisados 126 tubérculos e 39 folhas de plantas de batata infectadas com PVY, coletadas em campos comerciais localizados no sul de Minas Gerais. Inicialmente foram avaliados os sintomas apresentados pelas plantas provenientes dos tubérculos infectados e, em seguida, foram utilizadas as técnicas DAS e TAS-ELISA, RT-PCR multiplex e RT-qPCR para estimar a ocorrência e predominância de estirpes PVY, bem como a sua concentração nas plantas amostradas. Nas plantas originadas dos tubérculos infectados, os sintomas variaram de leve a severo, em todas as cultivares de batata, indicando uma provável variabilidade na época do ciclo em que foram infectadas. Do total de amostras submetidas ao teste sorológico TAS-ELISA, 46,1% mostrou comportamento sorológico compatível com estirpes pertencentes ao grupo de sorotipo O e 34,5% com o grupo N, enquanto que 23,9% foram positivas para infecções mistas e 5,5% não reagiram com nenhum dos antissoros monoclonais testados. Dentre estas, dez amostras apresentaram padrão sorológico não usual. No teste RT-PCR multiplex, as amostras com sorotipo O e N ao mesmo tempo, foram identificadas como portadoras de infecção mista com as estirpes PVYNTN e PVYN:O/N-Wi. As amostras com sorotipo O foram identificadas como PVYN:O/N-Wi e as amostras com sorotipo N foram identificadas como PVYNTN, exceto quando possuíam infecções mistas. Foram identificados 43,6% de PVYN:O/N-Wi, 37% de PVYNTN e 19,4% de infecções mistas. Foram selecionadas aleatoriamente para o teste de RT-qPCR 151 amostras. As concentrações da estirpe PVYNTN nas plantas com infecção mista, independentemente da sua origem, variaram de 2,79x107 a 2,79x1010 cópias virais/µl, enquanto que as concentrações da estirpe PVYN:O/N-Wi foram menores, variando de 2,41x103 a 4,13x106 cópias virais/µl. Sessenta e um isolados, que apresentaram perfil típico do recombinante PVYNTN na RT-PCR multiplex e RT-qPCR. Quando submetidos à reação de RT-PCR para amplificação do PVYE, 43 deles foram positivos apresentando perfil característico dessa estirpe recombinante, embora 9 isolados tenham apresentado padrões atípicos para o recombinante PVYE. A diversidade dos isolados de PVY, bem como a ocorrência de infecções mistas encontrada neste trabalho, fornece um panorama epidemiológico desse patógeno no país.
Abstract: The Potato virus Y (PVY) is considered the main virus with economic importance to potato culture in Brazil. One of the factors responsible for the increasing PVY diversity are mixed infections of strains that, during the viral replication process, can generate recombinants better adapted to environmental conditions with diverse biological, serological and molecular properties. In this paper, 126 tubers and 39 potato plant leaves infected with PVY, collected in commercial fields located in southern Minas Gerais were analyzed. Initially it was assessed the symptoms exhibited by plants from infected tubers and then DAS and TAS-ELISA, multiplex RT-PCR and RT-qPCR techniques were used to assess the occurrence and prevalence of PVY strains as well as their concentration in the sampled plants. In the plants originated from infected tubers, the symptoms vary from mild to severe in all potato cultivars, indicating a probable variability in the time cycle in which they were infected. In the TAS-ELISA serological testing, 46.1% of the samples showed serological behavior compatible with strains belonging to the 'O' serotype group and 34.5% with the ‘N’ group, while 23.9% were positive for mixed infections and 5.5% did not react with any of the tested monoclonal antisera. Among these, ten samples showed unusual serological pattern. In the multiplex RT-PCR test, the samples with O and N serotypes at the same time were identified as having mixed infection with PVYNTN and PVYN:O/N-Wi strains. Samples with O serotype were identified as PVYN:O/N-Wi and the ones with N serotype, as PVYNTN, except when they had mixed infections. It was identified 43,6% of PVYN:O/N-Wi, 37% of PVYNTN and 19,4% of mixed infections. One hundred and fifty-one samples were randomly selected for the RT-qPCR testing. The concentrations of PVYNTN strain in plants with mixed infections, regardless of its origin, varied from 2,79x107 to 2,79x1010 viral copies/µl, while the concentrations of PVYN:O/N-Wi were lower, ranging from 2,41x103 to 4,13x106 viral copies/µl. Sixty-one isolates showed typical profile of PVYNTN recombinant in RT-PCR multiplex and RT-qPCR. When subjected to RT-PCR for amplification of PVYE, 43 of them were positive, having a characteristic profile for this recombinant strain, although 9 isolates was also observed with atypical patterns for recombinant PVYE. The diversity of PVY isolates present in Brazilian fields of potatoes studied in this work, as well as the occurrence of mixed infections, provides a general epidemiological picture of this pathogen in the country.
URI: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/10809
Publisher: Universidade Federal de Lavras
???metadata.dc.language???: por
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