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Título: Prospecção e caracterização de SNP‟s relacionados à qualidade de carne ovina
Título Alternativo: Prospection and characterization of SNP's related to the quality of sheep meat
Autor(es): Esteves, Claudiana
Lattes: http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4439230E8
Orientador: Faria, Peter Bitencourt
Membro da banca: Peconick, Ana Paula
Membro da banca: França, Patrícia Maria de
Membro da banca: Livramento, Kalynka Gabriella do
Assunto: Polimorfismo
PCR-SSCP
Maciez da carne
Deposição de gordura
Polymorphism
Meat tenderness
Fat deposition
Data de Defesa: 7-Ago-2015
Data de publicação: 25-Fev-2016
Agência de Fomento: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Referência: ESTEVES, C. Prospecção e caracterização de SNP’s relacionados à qualidade de carne ovina. 2016. 128 p. Dissertação (Mestrado em Ciências Veterinárias)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2015.
Resumo: Objetivou-se com este trabalho, avaliar o polimorfismo por análise de mutações simples (SNP) de sete genes relacionados ao desenvolvimento muscular, à maciez e ao perfil lipídico da carne ovina (Calpastatina - CAST, Miostatina - GDF8, Estearol CoA Dessaturase – SCD, Domínio da Tioesterase – TE, Ácido Graxo Sintase – FASN e Diacilglicerol Aciltransferase -DGAT 1 e 2). Para o experimento, foram utilizados um total de 84 ovinos machos, constituídos em seis grupos genéticos, sendo estes derivados do cruzamento entre as raças: Santa Inês x Santa Inês, Santa Inês x Black Dorper, Santa Inês x White Dorper, Santa Inês x Texel, Santa Inês x Lacaune e Santa Inês x East Friesian. O delineamento foi inteiramente casualizado (DIC), com 6 (seis) tratamentos correspondendo aos cruzamentos com aproximadamente 14 (quatorze) repetições, onde cada animal foi considerado uma repetição. Em busca dos polimorfismos, foram realizadas análises baseadas na técnica PCRSSCP, que revelou diferentes padrões de leituras no gel de poliacrilamida. Os polimorfismos foram identificados a partir do sequenciamento das amostras com o auxílio do software livre Sequence Scanner Software (Applied Biosystems). A técnica de SSCP detectou um padrão único de banda nos genes DGAT-1 e SCD; dois padrões de bandas no gene FASN, três padrões nos genes GDF-8 e TE e quatro padrões nos genes CAST e DGAT-2. No gene CAST foram identificados quatro genótipos (AA, AB, BB e BC) e o sequenciamento identificou dois polimorfismos (c.227A>G; c.383A>G) que resultaram na troca do ácido glutâmico por glicina e treonina por alanina respectivamente. Já, para o gene GDF-8 foram observados três genótipos (DD, DE e FF) e o sequenciamento evidenciou a presença de 4 polimorfismos, nos quais não resultaram trocas de aminoácidos. No gene DGAT-2 foram identificados quatro genótipos (MO, MP, NP e MQ) e o sequenciamento, resultou na presença dois polimorfismos (c.229T>C; c.255T>C) que resultaram na troca da fenilalanina por leucina. No gene FASN, foram identificados dois genótipos (RS e RR). No gene TE, foram identificados três genótipos (TV, TT e UV) e o sequenciamento resultou na presença de 4 polimorfismos. Os genes DGAT-1 e SCD não relevaram, neste estudo, a presença de polimorfismo. Os resultados obtidos indicaram que o gene CAST, o gene GDF8 e o DGAT-2 apresentaram polimorfismos com mudanças na sequência de aminoácidos, podendo ou não resultar mudança na conformação final da proteína. Já, os genes DGAT-1 e SCD não apresentaram padrões diferenciados e nem SNPs e o gene FASN apresentou apenas padrões de bandas diferentes, mas sem SNPs.
Abstract: In this study, we sought to evaluate the polymorphism by means of analysis of point mutations (SNP) of seven genes related to muscle development to softness and lipid profile of sheep meat (calpastatin - CAST, myostatin - GDF8, Stearoyl CoA desaturase - SCD, field of thioesterase - TE, Fatty Acid Synthase - FASN and Diacylglycerol Acyltransferase - DGAT 1 and 2). We used 84 male sheep grouped in six genetic clusters obtained from a cross between the following races: Santa Ines × Santa Ines, Santa Inês × Dorper Black, White Dorper × Santa Inês, Santa Inês × Texel, Santa Inês × Lacaune, and Santa Inês × East Friesian. The experiment was established in completely randomized design (CRD) with six treatments corresponding to crossings with about 14 repetitions, each consisting of an animal. Analyzes were carried out seeking for polymorphisms, using the PCR-SSCP technique that showed results with different patterns in polyacrylamide gel. The sequencing of samples with the help of free software Sequence Scanner Software (Applied Biosystems) was used to identify polymorphisms. The SSCP technique detected a single standard band in DGAT-1 and SCD genes; two banding patterns in FASN gene in three patterns GDF-8 genes and TE four patterns in the CAST gene and DGAT-2. The CAST gene were identified four genotypes (AA, AB, BB and BC) and sequencing identified two polymorphisms (c.227A> G; c.383A> G) which resulted in the exchange of glutamic acid for glycine and threonine to alanine respectively. Since, for the GDF-8 gene were observed genotypes (DD, DE, FF) and sequencing revealed the presence of polymorphisms 4, which resulted in no exchange of amino acids. In DGAT-2 gene were identified four genotypes (MO, MP, NP and MQ) and sequencing resulted in the presence of two polymorphisms (c.229T> C; c.255T> C) which resulted in the exchange of phenylalanine to leucine. In FASN gene, they identified two genotypes (RS and RR). In the TE gene were identified three clones (TV, TT and UV) and sequencing resulted in the presence of 4 polymorphisms. The DGAT-1 and SCD genes do not relevaram this study, the presence of polymorphism. The results indicated that the CAST gene GDF8 gene and DGAT-2 polymorphisms showed changes in amino acid sequence and may or may not result in change in the final conformation of the protein. Already, DGAT-1 and SCD genes did not show different patterns and even SNPs and FASN gene showed only patterns of different bands, but no SNPs.
URI: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/10844
Publicador: Universidade Federal de Lavras
Idioma: por
Aparece nas coleções: DMV - Ciências Veterinárias - Mestrado (Dissertações)

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