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Title: Desenho de primers e clonagem do gene do capsídeo de fitovírus para uso como controles positivos na diagnose por RT-PCR
???metadata.dc.creator???: Sotero, Anderson de Jesus
???metadata.dc.contributor.advisor1???: Figueira, Antonia dos Reis
???metadata.dc.contributor.referee1???: Pinto, César Augusto Brasil Pereira
Souza, Ricardo Magela de
???metadata.dc.description.concentration???: Fitopatologia
Keywords: Plasmídeo
Pragas quarentenárias
Detecção molecular
Oligonucleotídeos
Plasmid
Quarantine pests
Molecular detection
Oligonucleotides
???metadata.dc.date.submitted???: 4-Oct-2010
Issue Date: 30-Jul-2014
Citation: SOTERO, A. de J. Desenho de primers e clonagem do gene do capsídeo de fitovírus para uso como controles positivos na diagnose por RT-PCR. 2010. 58 p. Dissertação (Mestrado em Fitopatologia)–Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2010.
???metadata.dc.description.resumo???: O constante intercâmbio de materiais vegetais para propagação, apesar de proporcionar um bom desempenho da atividade agrícola no Brasil, expõe o país ao risco de introdução de patógenos indesejados. Para evitar que isso aconteça, a diagnose precoce de fitopatógenos, tanto dos quarentenários como dos não quarentenários regulamentados é indispensável. No caso dos vírus, o estabelecimento de técnicas eficientes, para a sua diagnose, tem sido um grande desafio, pois, compõem um grupo de patógenos de plantas com elevada importância, em decorrência das perdas de produção que podem causar e, também, da ausência de métodos de controle curativos. Uma das maiores limitações, para o desenvolvimento desses métodos, é a falta de controles positivos, para checar a confiabilidade da técnica diagnóstica empregada, pois, sempre existe a possibilidade de obtenção de falsos negativos e/ou falsos positivos. Neste trabalho objetivou-se contribuir para a formação de um banco de controles positivos para vírus, por meio da clonagem do gene da proteína do capsídeo em plasmídeos e do desenho de primers para serem empregados na sua diagnose por RT-PCR. Foram clonados fragmentos genômicos de 3 vírus quarentenários e de 8 vírus não quarentenários. Todos os plasmídeos contendo os fragmentos genômicos virais e os primers foram testados e se comportaram como controles positivos confiáveis para serem empregados na diagnose dos respectivos vírus.
The frequent exchange of plant material for propagation, provides a good performance of agriculture in Brazil, but exposes the country to the risk of introducing unwanted pathogens. To prevent this, the early diagnosis of pathogens of both quarantine and the non-quarantine viruses is essential. Regarding to viruses, the establishment of efficient techniques for its diagnosis has been a great challenge, due to the high yield losses they can induce and also because there is no curative methods of controlling these pathogens. One of the major constraints to the development of these methods is the lack of positive controls to check the reliability of the diagnostic technique employed, since there is always the possibility of false negatives and/or false positives results. This study aimed to contribute for the formation of a bank of positive controls for the virus diagnosis, by cloning the gene of viral capsid in plasmid and design the primer to be used in virus diagnosis by RT-PCR. Genomic fragments of 3 quarantine viruses and 8 non-quarantine viruses were cloned and sequenced. All the plasmids with the genomic viral fragments and the designed primers were tested as positive controls and worked as a secure method for using in the diagnosis of viruses tested.
URI: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1825
Publisher: UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
???metadata.dc.language???: pt_BR
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