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Título: Estudos por ancoramento e dinâmica molecular de potenciais inibidores da Nucleosídeo Hidrolase de Bacillus anthracis
Título Alternativo: Docking and molecular dynamics studies of potential inhibitors of nucleoside hydrolase from Bacillus anthracis
Autor(es): Guimarães, Ana Paula
Orientador: Ramalho, Teodorico de Castro
Coorientador(es): Franca, Tanos Celmar Costa
Membro da banca: Freitas, Matheus Puggina de
Gonçalves, Arlan da Silva
Área de concentração: Agroquímica e Agrobioquímica
Assunto: Bacillus anthracis
Nucleoside hydrolase
Defesa contra agentes de guerra biológica
Dinâmica molecular
Ancoramento molecular
Nucleosídeo hidrolase
Molecular docking
Molecular dynamics
Biological warfare defense
Data de Defesa: 28-Jan-2010
Data de publicação: 30-Jul-2014
Referência: GUIMARÃES, A. P. Estudos por ancoramento e dinâmica molecular de potenciais inibidores da nucleosídeo hidrolase de Bacillus anthracis. 2010. 170 p. Dissertação (Mestrado em Agroquímica) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2010.
Resumo: A enzima nucleosídeo hidrolase (NH) se encontra largamente distribuída na natureza e, por não ter sido encontrada ainda em mamíferos, tem sido vista como um alvo ideal para a quimioterapia seletiva de doenças parasitárias e infecções bacterianas como o antraz. Apesar da disponibilidade de quimioterapia contra o antraz atualmente, o risco de desenvolvimento de resistência contra esses fármacos está sempre presente. Além disso, é muito provável que esses fármacos sejam ineficientes contra cepas geneticamente modificadas do Bacillus anthracis. Portanto, considerando o risco que esse agente de guerra biológica representa hoje em dia, é imperativa a busca por novos fármacos, bem como novos alvos moleculares para o desenvolvimento de quimioterapia contra o B. anthracis. Com base nisso, foram realizados, no presente trabalho, estudos por ancoramento molecular, visando analisar o posicionamento tridimensional de 12 inibidores conhecidos da NH de Tripanossoma vivax (TvNH) no sítio ativo da NH de B. anthracis (BaNH), assim como as principais interações desses compostos com os aminoácidos do sítio ativo da BaNH, e também avaliar os fatores relevantes para a atividade biológica de tais compostos. Posteriormente, foram realizadas simulações por dinâmica molecular (DM) para checar os resultados do ancoramento e selecionar os compostos mais promissores como lead compounds para o planejamento de potenciais inibidores para a BaNH. Os resultados de ancoramento, além de corroborar com os de dinâmica, sugerem uma boa correlação com os resultados experimentais dos ligantes. Também foi observado que os inibidores de TvNH podem vir a ser excelentes inibidores da BaNH.
The enzyme nucleoside hydrolase (NH) is largely found in nature but not in mammals being, for this reason, seen as an ideal target to selective chemotherapy against parasitic diseases and bacterial infections like anthrax. Despite of availability of chemotherapy against anthrax today, the risk of resistance emergence is always present. Besides, it is likely that this drug be inefficient against genetically modified strains of Bacillus anthracis. So, considering the risk represented by anthrax today, as a chemical warfare agent, it is mandatory the search for new drugs against B. anthracis. In line with this, we performed in the present work, molecular docking studies in order to analyze the tridimensional positioning of 12 known inhibitors Tripanossoma vivax NH (TvNH) in the active site of B. anthracis NH (BaNH), as well as the main interactions of these compounds with aminoacids of the BaNH active site, and, also, to evaluate the relevant factors to the biological activity of such compounds. Further, we performed Molecular Dynamics (MD) simulations in order to check the docking results and select the most promising inhibitors as lead compounds to the design of potential inhibitors to BaNH. Docking results, besides corroborating with the MD simulations, suggested a good correlation with experimental results. We also observed that TvNH inhibitors could, as well, be excellent BaNH inhibitors.
URI: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1866
Publicador: UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
Idioma: pt_BR
Aparece nas coleções: DQI - Agroquímica - Mestrado (Dissertações)

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