1. RI UFLA
  2. Programas de Pós-Graduação - Teses e Dissertações
  3. Estatística e Experimentação Agropecuária - Mestrado (Dissertações)
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dc.creatorOliveira, Deive Ciro de-
dc.date.accessioned2017-12-18T15:58:14Z-
dc.date.available2017-12-18T15:58:14Z-
dc.date.issued2017-12-18-
dc.date.submitted2005-02-28-
dc.identifier.citationOLIVEIRA, D. C. de. Cadeia de Markov com estados latentes com aplicação em análises de seqüências de DNA. 2005. 180 p. Dissertação (Mestrado em Estatística e Experimentação Agropecuária) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2005.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/28287-
dc.descriptionEsta dissertação/tese está disponível online com base na Resolução CEPE nº 090, de 24 de março de 2015, disponível em http://www.biblioteca.ufla.br/wordpress/wp-content/uploads/res090-2015.pdf, que dispõe sobre a disponibilização da coleção retrospectiva de teses e dissertações online no Repositório Institucional da UFLA, sem autorização prévia dos autores. Parágrafo Único. Caberá ao autor ou orientador a solicitação de restrição quanto à divulgação de teses e dissertações com pedidos de patente ou qualquer embargo similar. Art. 5º A obra depositada no RIUFLA que tenha direitos autorais externos à Universidade Federal de Lavras poderá ser removida mediante solicitação por escrito, exclusivamente do autor, encaminhada à Comissão Técnica da Biblioteca Universitária./ Arquivo gerado por meio da digitalização de material impresso. Alguns caracteres podem ter sido reconhecidos erroneamente.-
dc.description.abstractHidden Markov models (HMM's) are applied to locate segments with homogeneous C+G proportions (DNA sequence segmentation). The HMM's are showed in a didactic way and the methods ofan extended model are obtained. The isMalgorithm is used to obtain maximum-likehood estimators ofHMM's. A software that implement some HMMs methods was developed and applied to sequences fragments from Xylella fastidiosa, Escherichia coli, Streptococcus pneumoniae, Xanthomonas axonopodis pv. citri, and the complete genome of bacteriophage lambda. The results are discussed and compared with the research ofChurchill (1989) and da Silva (2003).pt_BR
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Lavraspt_BR
dc.rightsacesso abertopt_BR
dc.subjectModelo de Markovpt_BR
dc.subjectAnálise sequencialpt_BR
dc.subjectEstatísticapt_BR
dc.subjectBiologia molecularpt_BR
dc.titleCadeia de Markov com estados latentes com aplicação em análises de seqüências de DNApt_BR
dc.title.alternativeHidden Markov Chain with applicatíon in DNA sequence analysipt_BR
dc.typedissertaçãopt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Estatística e Experimentação Agropecuáriapt_BR
dc.publisher.initialsUFLApt_BR
dc.publisher.countrybrasilpt_BR
dc.contributor.advisor1Chaves, Lucas Monteiro-
dc.contributor.referee1Silva, Cibele Queiroz da-
dc.contributor.referee2Sáfedi, Thelma-
dc.description.resumoA teoria das Cadeias de Markov com estados latentes, HMM's (hidden markov models\ é aplicada ao problema de discriminação de regiões homogêneas em seqüências de DNA. Uma abordagem didática é apresentada e os métodos de uma extensão do modelo são deduzidos. O algoritmo EM (ExpectationMaximization) é utilizado para obtenção de estimativas de máxima verossimilhança. Um software específico foi desenvolvido e aplicado na seqüência de DNA completa do vírus bacteriófago lambda, e em fragmentos do genoma das bactérias Xylella fastidiosa, Escherichia coli, Streptococcus pneumoniae, Xanthomonas axonopodis pv. citri. Os resultados obtidos são comparados com os trabalhos de Churchill (1989) e da Silva(2003).pt_BR
dc.publisher.departmentDepartamento de Ciências Exataspt_BR
dc.subject.cnpqEstatísticapt_BR
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