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Título: Identification and functional characterization of diazotrophic β-proteobacteria from Brazilian soils
Título Alternativo: Identificação de diazotróficos pertencentes à subclasse β-proteobactéria isolados de solos brasileiros
Autor(es): Silva, Krisle da
Orientador: Moreira, Fátima Maria de Souza
Membro da banca: Souza, Ricardo Magela de
Cardoso, Patrícia Gomes
Área de concentração: Microbiologia Agrícola
Assunto: Microorganismos do solo
Data de Defesa: 26-Ago-2009
Data de publicação: 18-Ago-2014
Referência: SILVA, K. da. Identification and functional characterization of diazotrophic ß-Proteobacteria from Brazilian soils. 2009. 124 p. Tese (Doutorado em Microbiologia Agrícola)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2009.
Resumo: Different isolates belonging to class β-Proteobacteria were obtained from Amazonian soils, in the Amazonas, Rondônia and Acre States and also from soils of Minas Gerais State. The isolates obtained from Amazonian soils are belonging to Burkholderia genus and from Minas Gerais State to Cupriavidus genus. All isolates were captured by using different trap plants. The Burkholderia isolates were captured by using siratro (Macroptilium atropurpureum), common bean (Phaseolus vulgaris), Indigofera suffruticosa and Pithecellobium sp. Cupriavidus isolates were obtained using common bean (P. vulgaris), cowpea (Vigna unguiculata) and leucaena (Leucaena leucocephala). The aims of this work were: to evalute plant growth promotion traits of Burkholderia isolates and to identify by genotypic and phenotypic characteristics the isolates of Burkholderia and Cupriavidus. The isolates of Burkholderia were evaluate by cultural characterization on 79 medium, biochemical characteristics, total protein profiles by SDS-PAGE and by plant growth promotion traits (nitrogenase activity on free nitrogen medium; solubilisation of calcium, iron and aluminium phosphates and antifungal activity against Fusarium oxysporium f. sp. phaseoli), 16S rDNA, gyrB, and recA gene sequencing and multilocus sequence typing specific to Burkholderia cepacia complex. The isolates of Cupriavidus were characterized by total protein profiles by SDS-PAGE, 16S rDNA and gyrB gene sequecing and nodC and nifH sequencing, beyond it, they were re-inoculed on the legumes which were isolated. The isolates of Burkholderia were phenotyoically diverse depending of the plant which they were captured. The most of isolates fixed nitrogen on culture medium, solubilized calcium phosphate, but only one isolate presented antifungal activity. The isolates of Burkholderia were identified as B. fungorum (isolated from siratro), B. caribensis (Indigofera suffruticosa); B. contaminans (common bean) and B. lata (Pithecellobium sp.). The isolates of Cupriavidus were identified as C. necator, and one of them efficiently nodulated common beans plants. This is the first report of the occurrence of biological nitrogen fixation by B. fungorum, B. contaminans, B. lata and C. necator species.
Diferentes isolados pertencentes à classe β-proteobactéria foram obtidos de solos da região Amazônica, compreendendo os estados do Amazonas, Rondônia e Acre, e também em áreas de pastagem de solos do estado de Minas Gerais. Os isolados obtidos da região Amazônica pertencem ao gênero Burkholderia e os de Minas Gerais ao gênero Cupriavidus. Todos os isolados foram capturados utilizando-se diferentes plantas iscas. As bactérias do gênero Burkholderia foram capturadas utilizando-se siratro (Macroptilium atropurpureum), feijão-comum (Phaseolus vulgaris), Indigofera suffruticosa e Pithecellobium sp. Já os isolados de Cupriavidus foram obtidos utilizando-se feijão (P. vulgaris), feijão-caupi (Vigna unguiculata) e leucena (Leucaena leucocephala). Os objetivos foram: avaliar as características de promoção do crescimento vegetal dos isolados de Burkholderia e identificar, por meio de características fenotípicas e genotípicas, os isolados de Burkholderia e Cupriavidus. Para os isolados de Burkholderia foram utilizados caracterização cultural em meio 79, caracterização bioquímica, perfil total de proteínas por meio de SDS-PAGE, características de promoção do crescimento vegetal (fixação biológica de nitrogênio atmosférico em meio de cultura livre de N; solubilização de fosfatos de cálcio, ferro e alumínio e atividade antifúngica contra Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli), sequenciamento total do gene 16S rDNA, sequenciamento do gene gyrB; amplificação e sequenciamento do gene recA e multilocus sequence typing (MLST) específicos para complexo Burkholderia cepacia. Os isolados de Cupriavidus foram caracterizados quanto ao perfil total de proteínas por meio de SDS-PAGE, sequenciamento total do gene 16S rDNA, sequenciamento do gene gyrB e sequenciamento dos genes nodC e nifH. Além disso, eles foram autenticados na espécie em que foram isolados. Os isolados de Burkholderia foram diversos fenotipicamente, dependendo da planta da qual foram capturados. A grande maioria fixou nitrogênio em meio de cultura, solubilizou fosfato de cálcio, mas apenas um isolado apresentou atividade antifúngica. Os isolados de Burkholderia foram identificados como B. fungorum (isolado a partir de siratro), B. caribensis (Indigofera suffruticosa), B. contaminans (feijão) e B. lata (Pithecellobium). Os isolados de Cupriavidus foram identificados como C. necator e um deles apresentou eficiente nodulação em plantas de feijão. Este é o primeiro relato da ocorrência de fixação biológica de nitrogênio por espécies de B. fungorum, B. contaminans, B. lata e C. necator.
URI: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/2871
Publicador: UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
Idioma: en
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