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metadata.teses.dc.title: Fusarium fujikuroi species complex in brazilian rice
metadata.teses.dc.title.alternative: Complexo de espécies Fusarium fujikuroi em arroz brasileiro
metadata.teses.dc.creator: Nicolli, Camila Primieri
metadata.teses.dc.creator.Lattes: http://lattes.cnpq.br/0113391018384989
metadata.teses.dc.contributor.advisor1: Pfenning, Ludwig Heinrich
metadata.teses.dc.contributor.advisor-co1: Del Ponte, Emerson Medeiros
metadata.teses.dc.contributor.referee1: Medeiros, Flávio Vasconcelos de
metadata.teses.dc.contributor.referee2: Ferreira, Maria Alves
metadata.teses.dc.contributor.referee3: Moretti, Antonio
metadata.teses.dc.contributor.referee4: Del Ponte, Emerson Medeiros
metadata.teses.dc.subject: Oryza sativa
Bakanae disease
FUM genes
Mycotoxins
Contaminated grains
Bakanae
Fumonisin
Genes FUM
Micotoxinas
Grãos contaminados
metadata.teses.dc.date.issued: 13-Feb-2019
metadata.teses.dc.description.sponsorship: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPQ)
metadata.teses.dc.identifier.citation: NICOLLI, C. P. Fusarium fujikuroi species complex in brazilian rice. 2018. 73 p. Tese (Doutorado em Agronomia/Fitopatologia)–Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2018.
metadata.teses.dc.description.resumo: Membros do complexo de espécies Fusarium fujikuroi (FFSC) são produtores de micotoxinas, principalmente de fumonisinas (FBs). Neste trabalho estudamos: a diversidade de espécies de FFSC em arroz, a presença de genes essenciais da via metabólica de fumonisina, a capacidade de produção de fumonisinas in vitro e a ocorrência natural de micotoxinas no arroz. Sequenciamos 100 isolados para três regiões gênicas (TEF, TUB, CAL). A árvore filogenética mostrou que as espécies mais freqüentes foram F. fujikuroi, F. proliferatum e F. verticillioides, depois F. anthophilum, F. pseudocircinatum e F. sterilihyphosum. Além, de duas novas linhagens filogenéticas, Fusarium sp. 1 e Fusarium sp. 2. Todos os isolados foram analisados quanto à presença dos genes FUM1, FUM8 e FUM14 e para o subgrupo de 61 isolados foi analisado a capacidade de produção de fumonisinas in vitro. Quase todos os isolados foram positivos para os genes. As espécies F. fujikuroi, F. proliferatum e F. verticillioides produziram fumonisinas B1, B2 e B3 in vitro, F. pseudocircinatum, Fusarium sp. 1 e Fusarium sp. 2 produziram apenas FB1 e F. anthophilum e F. sterilihyphosum não produziram nenhuma dessas micotoxinas. A ocorrência natural de micotoxinas foi analisada em 93 amostras subdivididas em farinha de arroz e casca de arroz. Todas as micotoxinas analisadas foram detectadas, 87% das amostras de arroz estavam contaminadas com pelo menos uma das micotoxinas analisadas e 16% não apresentaram nenhuma contaminação. Dentre as micotoxinas analisadas, a beauvericina foi a micotoxina mais prevalente nos grãos de arroz brasileiros. Este é o primeiro relato sobre a associação de vários membros do FFSC com grãos de arroz no Brasil, a capacidade dessas espécies em produzir fumonisinas e a contaminação natural dos grãos de arroz por micotoxinas. Considerando a relevância do arroz na alimentação da população brasileira, nossos resultados contribuem com novos conhecimentos para a melhoria dos modelos de avaliação do risco da produção de arroz com micotoxinas no Brasil. Uma vez que, este estudo indica uma ameaça potencial à qualidade do arroz brasileiro. A tese está dividida em três capítulos. O primeiro capítulo é a revisão sobre bakanae, o complexo de espécies Fusarium fujikuroi e as micotoxinas. O segundo capítulo sobre a diversidade de espécies de FFSC no arroz e a ocorrência natural de micotoxinas. E o terceiro capítulo sobre a capacidade das espécies presentes no Brasil de produzir fumonisinas.
metadata.teses.dc.description.abstract: Members of the Fusarium fujikuroi species complex (FFSC) are producers of mycotoxins, mainly fumonisins (FBs). In this work, we studied the FFSC species diversity on rice, the presence of essential fumonisin metabolic pathway genes, fumonisin production capacity in vitro and the natural occurrence of mycotoxins in rice. We sequenced 100 isolates for three gene regions (TEF, TUB, CAL). The phylogenetic tree showed that the most frequent species were F. fujikuroi, F. proliferatum and F. verticillioides, then F. anthophilum, F. pseudocircinatum and F. sterilihyphosum. In addition, we found two new phylogenetic lineages, Fusarium sp. 1 and Fusarium sp. 2. All isolates were analyzed for the presence of the FUM1, FUM8 and FUM14 genes and for a the subgroup of 61 isolates the fumonisin production capacity in vitro was assessed. Almost all isolates were gene positive. The species F. fujikuroi, F. proliferatum and F. verticillioides produced fumonisins B1, B2 and B3 in vitro, F. pseudocircinatum, Fusarium sp. 1 and Fusarium sp. 2 produced only FB1, while F. anthophilum and F. sterilihyphosum did not produce any. The natural occurrence of mycotoxins was analyzed in 93 samples subdivided in rice flour and rice hull. All the mycotoxins analyzed were detected, 87% of rice samples were contaminated with at least one of the mycotoxins and 16 % there is no contamination. Among the mycotoxins analyzed, beauvericin was the most prevalent mycotoxin on Brazilian rice grains. This is the first report on the association of several FFSC members with rice grains in Brazil, the ability of these species to produce fumonisins and the natural contamination of rice grains by mycotoxins. Considering the importance of rice in the Brazilian population, our results contribute with new knowledge for the improvement of models for assessing the risk of mycotoxin production on rice in Brazil. Since this study indicates a potential threat to the quality of Brazilian rice. The thesis is divided into three chapters. The first chapter is the review on bakanae, the complex of Fusarium fujikuroi species and mycotoxins. The second chapter on the diversity of FFSC species in rice and the natural occurrence of mycotoxins. And the third chapter on the ability of species present in Brazil to produce fumonisins.
metadata.teses.dc.description: Arquivo retido, a pedido do autor(a), até agosto de 2019.
metadata.teses.dc.identifier.uri: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/32768
metadata.teses.dc.publisher: Universidade Federal de Lavras
metadata.teses.dc.language: eng
Appears in Collections:DFP - Agronomia/Fitopatologia - Doutorado (Teses)

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