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Título: Avaliação da razão de verossimilhança generalizada em testes de hipóteses sobre o controle genético de características contínuas
Título Alternativo: Evaluation of the generalized likelihood ratio test of hypotheses on the genetic control of continuous traits
Autor(es): Gonçalves, Renata Pires
Orientador: Bearzoti, Eduardo
Membro da banca: Ferreira, Daniel Furtado
Tavares, Marcelo
Veiga, Ruben Delly
Área de concentração: Estatística e Experimentação Agropecuária
Assunto: Misturas de normais
Gene de efeito maior
Simulação de dados
Mixtures of normal
Major gene
Computer simulation
Data de Defesa: 5-Fev-2004
Data de publicação: 10-Set-2014
Referência: GONÇALVES, R. P. Avaliacao da razao de verossimilhanca generalizada em testes de hipoteses sobre o controle genetico de caracteristicas continuas. 2004. 37 p. Dissertação(Mestrado em Estatística e Experimentação Agropecuária)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2004.
Resumo: Estudos de herança genética em plantas são realizados para caracterizar os efeitos genéticos e verificar a existência de um gene de efeito maior e/ou de genes de pequeno efeito ("poligenes"). Quando a característica de interesse é contínua, a verossimilhança é baseada em modelos de misturas de densidades normais. Uma vez que não há testes exatos evidentes para julgar a existência de um gene de efeito maior, a razão de verossimilhança generalizada é em geral utilizada, considerando a aproximação de qui-quadrado. Este trabalho objetivou avaliar esta estatística de teste através de simulação em computador. Dados foram simulados, considerando particularidades de genealogia típicas de tais estudos e duas condições sob a hipótese de nulidade, ou seja, sem a presença de um gene de efeito maior e sem a presença de genes de pequeno efeito (poligenes), para avaliar o controle do erro tipo I. O poder do teste foi avaliado com ambos presentes. No processo de simulação, foram variados o tamanho de amostra e valores do coeficiente de herdabilidade. Resultados indicaram que, embora a distribuição empírica da razão de verossimilhança se tenha desviado significativamente da distribuição de qui-quadrado, houve controle do erro tipo I, considerando um nível de significância nominal de 5%. O poder é elevado para detectar poligenes e gene de efeito maior, em geral. O poder é baixo para detectar gene de efeito maior quando a proporção da variação genética explicada por este é baixa.
Studies of genetic control in plants are carried out to characterize genetic effects and detect the existence of a major gene and/or genes of minor effects (polygenes). If the trait of interest is continuous, the likelihood can be constructed based on a model with mixtures of normal densities. Once exact tests are not evident with such models, the likelihood ratio test is generally used, using the chi-square approximation. This work aimed at evaluating such test statistic using computer simulation. Data sets were simulated using generations typical in plant studies, under two conditions of null hypothesis, without a major gene, and without polygenes. The power of test was evaluated with both types of genes present. Different sample sizes and values of heritability were considered. Results showed that, although the empirical densities of the test statistic departed significantly from a chi-square distribution, under null hypotheses, there was a reasonable control of type I error, with a significance level of 5%. The power of the test was generally high to detect polygenes and major genes. Power is low to detect a major gene only when it explains a low fraction of genetic variation.
URI: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/3647
Publicador: UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
Idioma: pt_BR
Aparece nas coleções: DEX - Estatística e Experimentação Agropecuária - Mestrado (Dissertações)

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