Buscar

 

RI UFLA (Universidade Federal de Lavras) >
DCC - Departamento de Ciência da Computação >
DCC - Graduação >
DCC - Bacharelado em Ciência da Computação (Monografias) >

Por favor, utilize esse identificador para citar este item ou usar como link: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/5298

Título: Uma metodologia para identificação de módulos formadores de sequências de proteínas mosaicas do trypanosoma cruzi a partir do transcriptoma do parasito utilizando a ferramenta blast
Autor(es): Lima, Elisa Boari de
Orientador: Rodrigues, Thiago de Souza
Membro da banca: Uchôa, Joaquim Quinteiro
Pereira, Marluce Rodrigues
Área de concentração: Bioinformática
Assunto: Bioinformática
Proteínas mosaicas
Trypanosoma cruzi
Transcriptoma
Blast
Bioinformatics
Mosaic proteins
Transcriptome
Data de Defesa: 18-Nov-2008
Data de publicação: 10-Abr-2015
Referência: LIMA, E. B. de. Uma metodologia para identificação de módulos formadores de sequências de proteínas mosaicas do trypanosoma cruzi a partir do transcriptoma do parasito utilizando a ferramenta blast. 2008. 53 p. Monografia (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2008.
Resumo: Este trabalho propôs uma metodologia de identificação de módulos formadores de sequências nucleotídicas codificadoras de proteínas mosaicas do Trypanosoma cruzi utilizando a ferramenta BLAST. Para o desenvolvimento da metodologia, foi utilizada a família MASP de proteínas e aplicado inicialmente o conjunto de valores padrão dos parâmetros da ferramenta. Posteriormente foram estudadas diferentes combinações de valores de parâmetros a fim de comparação de resultados, incluindo valores indicados pela literatura. A metodologia desenvolvida provou ser eficaz para o objetivo proposto, obtendo melhores resultados quando aplicados valores diferentes dos valores padrão para filtro de regiões de baixa complexidade, E-value e tamanho inicial de palavra.
Abstract: This paper proposed a methodology for the identifying component modules of nucleotide sequences that code Trypanosoma cruzi mosaic proteins using BLAST. For the development of the methodology, MASP protein family was used and a set of default BLAST parameter values was initially applied. Afterwards, different combinations of parameter values were studied for result comparison, including those indicated in literature. The developed methodology proved to be efficient for the proposed objective, obtaining better results when non-default parameter values for low complexity region filter, E-value and initial word size were applied.
URI: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/5298
Idioma: pt_BR
Aparece nas coleções: DCC - Bacharelado em Ciência da Computação (Monografias)

Arquivos neste Item:

Arquivo Descrição TamanhoFormato
Elisa_Monografia.pdf1,22 MBAdobe PDFVer/abrir
Elisa_Apresentacao.pdfApresentação da monografia1,17 MBAdobe PDFVer/abrir
Elisa_Artigo.pdfArtigo da monografia709,19 kBAdobe PDFVer/abrir

Itens protegidos por copyright, com todos os direitos reservados, Salvo indicação em contrário.


Mostrar estatísticas

 


DSpace Software Copyright © 2002-2007 MIT and Hewlett-Packard - Feedback