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Título: Codificação e clustering de proteínas
Autor : Araújo, Gustavo Figueiredo
Primeiro orientador: Rodrigues, Thiago de Souza
Primeiro membro da banca: Castro, Cristiano Leite de
Pereira, Marluce Rodrigues
Área de concentração: Bioinformática
Palavras-chave: Codificação de proteínas
Comparação de sequências
Clustering de proteínas
Coding of protein
Comparing sequences
Clustering of proteins
Data da publicação: 15-Abr-2015
Referência: ARAÚJO, G. F. Codificação e clustering de proteínas. 2007. 36 p. Monografia (Graduação em Ciência da Computação) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2007.
Resumo: Este trabalho visa analisar o método de codificação de seqüências Sequence Coding by Sliding Window (SCSW) aplicado na codificação de seqüências de aminoácidos. Para realizar a avaliação do método, foi utilizado o algoritmo de clusterização K-Means, a fim de verificar a eficácia do método de codificação na comparação de similaridades entre seqüências. Apesar de levantados alguns problemas no método SCSW, os resultados mostraram que esse método pode ser útil na determinação de similaridade entre seqüências, entretanto estes problemas devem ser minimizados a fim de se obter melhores resultados.
Abstract: This work aims to analyze the method of coding sequences called here Coding Sequence by Sliding Window (SCSW) applied in amino acids sequences. The K-Means clustering algorithm was used to verify the SCSW effectiveness comparing the similarities between the original sequences. The results showed that this method can be useful in determining the similarity between sequences, however some problems should be solved or minimized in order to obtain better results.
URI: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/5317
Idioma: pt_BR
Aparece nas coleções:DCC - Bacharelado em Ciência da Computação (Monografias)

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