1. RI UFLA
  2. Programas de Pós-Graduação - Teses e Dissertações
  3. Ciências Veterinárias - Doutorado (Teses)
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dc.creatorPereira, Carine Rodrigues-
dc.date.accessioned2023-08-07T16:24:43Z-
dc.date.available2023-08-07T16:24:43Z-
dc.date.issued2023-08-07-
dc.date.submitted2023-06-23-
dc.identifier.citationPEREIRA, C. R. Genomic epidemiology of Brucella abortus isolated from cattle in Brazil. 2023. 104 p. Tese (Doutorado em Ciências Veterinárias)–Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2023.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/58238-
dc.description.abstractBovine brucellosis is a bacterial zoonosis that affects livestock and public health. In Brazil, it is caused mainly by Brucella abortus. The disease causes reproductive clinical signs in cattle, such as abortions and premature births, and nonspecific clinical signs in humans, as fever, arthralgia, night sweats, among others. In humans, the treatment is difficult, and the combination of synergistic antimicrobials for periods of 4 to 6 weeks is preconized. The aims of this study were (1) to perform a systematic review of antimicrobial resistance (AMR) in Brucella spp.; (2) to identify the genetic mechanisms related to AMR in Brucella abortus isolated from cattle in Brazil; (3) to compare the population structure of the genomes of 53 Brazilian B. abortus isolates using eight different genotyping methods; (4) to perform a pan-genome analysis of this species and (5) to describe the identification and complete sequencing of the first strain of Pseudochrobactrum saccharolyticum isolated in Latin America, previously classified as B. abortus. It was possible to identify that Brucella spp. is mainly resistant to rifampicin and aminoglycosides, the mechanisms of genetic resistance in the genus are still poorly understood, and this could be attributed to the high number of hypothetical proteins that remain with their unknown function in this pathogen. In addition, it is essential that the solutions regarding any questions using the implementation of bioinformatics methods always consider the epidemiological context of a isolated strain. Genomics was a fundamental tool to answer several questions related to B. abortus strains from Brazil and enabled the identification of a genus from Brucellaceae family hitherto never found in the country. The intercession between the epidemiological and whole genome sequence information of the strains investigated provided important information on specific nuances of the Brucellaceae family, especially B. abortus, providing a better understanding of this pathogen of worldwide importance.pt_BR
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)pt_BR
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG)pt_BR
dc.description.sponsorshipConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)pt_BR
dc.languageengpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Lavraspt_BR
dc.rightsacesso abertopt_BR
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectBrucellosispt_BR
dc.subjectWhole genome sequencingpt_BR
dc.subjectSurveillancept_BR
dc.subjectAntimicrobial resistancept_BR
dc.subjectBrucelosept_BR
dc.subjectSequenciamento completo do genomapt_BR
dc.subjectVigilânciapt_BR
dc.subjectResistência antimicrobianapt_BR
dc.titleGenomic epidemiology of Brucella abortus isolated from cattle in Brazilpt_BR
dc.title.alternativeEpidemiologia genômica de brucella abortus isoladas de bovinos no Brasilpt_BR
dc.typetesept_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Ciências Veterináriaspt_BR
dc.publisher.initialsUFLApt_BR
dc.publisher.countrybrasilpt_BR
dc.contributor.advisor1Dorneles, Elaine Maria Seles-
dc.contributor.advisor-co1Azevedo, Vasco Ariston de Carvalho-
dc.contributor.referee1Dorneles, Elaine Maria Seles-
dc.contributor.referee2O'Callaghan, David-
dc.contributor.referee3Lage, Andrey Pereira-
dc.contributor.referee4Viana, Marcus Vinicius Canário-
dc.contributor.referee5Soares, Siomar de Castro-
dc.description.resumoA brucelose bovina é uma zoonose bacteriana que afeta a pecuária e a saúde pública. No Brasil, é causada principalmente pela Brucella abortus. A doença causa sinais clínicos reprodutivos em bovinos, como abortos e partos prematuros, e sinais clínicos inespecíficos em humanos, como febre, artralgia, sudorese noturna, entre outros. Em humanos, o tratamento é difícil, preconizando-se a combinação de antimicrobianos sinérgicos por períodos de 4 a 6 semanas. Os objetivos deste estudo foram (1) realizar uma revisão sistemática da resistência antimicrobiana (AMR) em Brucella spp.; (2) identificar os mecanismos genéticos relacionados à AMR em Brucella abortus isolados de bovinos no Brasil; (3) comparar a estrutura populacional dos genomas de 53 isolados brasileiros de B. abortus usando oito diferentes métodos de genotipagem; (4) realizar uma análise pan-genômica desta espécie e (5) descrever a identificação e sequenciamento completo da primeira cepa de Pseudochrobactrum saccharolyticum isolada na América Latina, previamente classificada como B. abortus. Foi possível identificar que Brucella spp. é principalmente resistente à rifampicina e aos aminoglicosídeos, os mecanismos de resistência genética no gênero ainda são pouco compreendidos, e isso pode ser atribuído ao elevado número de proteínas hipotéticas que permanecem com função desconhecida neste patógeno. Além disso, é fundamental que as soluções de quaisquer dúvidas com a aplicação de métodos de bioinformática sempre considerem o contexto epidemiológico de uma cepa isolada. A genômica foi uma ferramenta fundamental para responder a diversas questões relacionadas às cepas de B. abortus do Brasil e possibilitou a identificação de um gênero da família Brucellaceae até então nunca encontrado no país. A intercessão entre as informações epidemiológicas e do sequenciamento completo do genoma das cepas investigadas forneceu informações importantes sobre nuances específicas da família Brucellaceae, especialmente B. abortus, proporcionando um melhor entendimento deste patógeno de importância mundial.pt_BR
dc.publisher.departmentDepartamento de Medicina Veterináriapt_BR
dc.subject.cnpqDoenças Infecciosas de Animaispt_BR
dc.creator.Latteshttps://lattes.cnpq.br/6179412993495748pt_BR
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