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http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/59091
Full metadata record
DC Field | Value | Language |
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dc.creator | Porto, Antônio Carlos da Mota | - |
dc.date.accessioned | 2024-04-16T15:04:22Z | - |
dc.date.available | 2024-04-16T15:04:22Z | - |
dc.date.issued | 2024-04-16 | - |
dc.date.submitted | 2022-12-16 | - |
dc.identifier.citation | PORTO, A. C. da M. Estratégias para exploração do germoplasma e aptidão para cultivo de Toona ciliata no Brasil. 2024. 78 p. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas)–Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2022. | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/59091 | - |
dc.description.abstract | Toona ciliata M. Roem is one of the most important species for timber production and has been increasingly planted worldwide in tropical and subtropical regions. Despite its high timber value and its ecological importance, the species lacks basic information such as genetic variability, genome-widestudies, structure of forest tree breeding programs and edaphoclimaticsuitability. For a sustainable exploration of a species, genomic tools can be used to access genomic variability, useful information both for population management in breeding programs and for the conservation of natural populations. In addition, knowledge of the edaphoclimatic conditions required by it is fundamental for allocating plantations in environments with high yield potential and assisting breeding programs to develop populations for wide edaphoclimatic conditions. Thus, the present study aims to: (i) infer about the structure of quantitative character variability in native subpopulations of T.ciliata introduced from Australia; (ii) Fit the climate zoning for T. ciliata in Brazil, aiming to provide subsidies for the allocation of new planted forests (ii) identify and characterize microsatellite regions in the genome of T. ciliata. For genetic evaluations, 74 progenies of T. ciliata, from 13 subpopulations sampled in Australia, were phenotyped for total height (m) and diameter (cm) and data were fitted in mixed linear models for subsequent estimation of genetic parameters. For climate zoning, data from the natural occurrence of T. ciliata in Australia were used to train a logistic model using 20bioclimatic as predictor variables. The prediction of T. ciliata in Brazilian territory was doneusing historical climatic normals (1970-2000) and predicted for three future periods: 2021-2040; 2041-2060 and 2061-2080 using the predictive model of climate change. The MISA (MIcroSAtellite Identification Tool) pipelinewas used to identify microsatellite loci (SSR) in the T. ciliata genome and subsequently classify them according to type, motif size and number of repeats. The results of the genetic evaluations for quantitative traits showed medium to high structuring of the quantitative variance of T. ciliata between subpopulations, with Q_stvalues ranging from 0.14 and 0.23 for height and diameter, respectively. The individual narrow-sense heritability (h_a^2) estimated for the two traits were moderate (0.31 and 0.25, respectively). The highest selection gains were obtained for diameter while the highest values of effective population size (N_e) were obtained for height. As for climate zoning, 65.1% of the Brazilian territory was classified as areas of high and good suitability for T. ciliataplanting, with a concentration of areas of high suitability in the north and south of Brazil, with precipitation (mm) being the edaphoclimatic condition with the greatest influence on fitness prediction. 39,085 SSR loci were identified in the genome of T. ciliata, where 32.3% were classified as mononucleotides, 56.8% were dinunucleotides, 7.9% were classified as tri-, tetra-, penta- and hexanucleotides, as well as 3% of total loci were classified as complex SSRs. Dinucleotides with 10 and 11 repeats were the most abundant loci and the most frequent type of motif was the AT/AT mononucleotide, representing 42.8% of the total number of motifs. | pt_BR |
dc.description.sponsorship | Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) | pt_BR |
dc.language | por | pt_BR |
dc.publisher | Universidade Federal de Lavras | pt_BR |
dc.rights | acesso aberto | pt_BR |
dc.rights | Attribution 4.0 International | * |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | * |
dc.subject | Identificação genômica ampla | pt_BR |
dc.subject | Melhoramento florestal | pt_BR |
dc.subject | Divergência genética quantitativa | pt_BR |
dc.subject | Zoneamento climático | pt_BR |
dc.subject | Marcadores SSR | pt_BR |
dc.subject | Repetições de sequências simples | pt_BR |
dc.subject | Genome-wide identification | pt_BR |
dc.subject | Forest tree breeding | pt_BR |
dc.subject | Quantitative genetic divergence | pt_BR |
dc.subject | Climatic zoning | pt_BR |
dc.subject | SSR markers | pt_BR |
dc.subject | Simple sequence repeats | pt_BR |
dc.subject | Qst | pt_BR |
dc.subject | SSR | pt_BR |
dc.title | Estratégias para exploração do germoplasma e aptidão para cultivo de Toona ciliata no Brasil | pt_BR |
dc.title.alternative | Strategies for germplasm exploration and suitability for planting of Toona ciliata in Brazil | pt_BR |
dc.type | tese | pt_BR |
dc.publisher.program | Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas | pt_BR |
dc.publisher.initials | UFLA | pt_BR |
dc.publisher.country | brasil | pt_BR |
dc.contributor.advisor1 | Novaes, Evandro | - |
dc.contributor.referee1 | Gonçalves, Flávia Maria Avelar | - |
dc.contributor.referee2 | Resende, Rafael Tassinari | - |
dc.contributor.referee3 | Nunes, Andrei Caique Pires | - |
dc.contributor.referee4 | Silva, Paulo Henrique Müller da | - |
dc.description.resumo | Toona ciliata M. Roem é uma das espécies mais importantes para a produção de madeira e tem sido cada vez mais plantada em todo o mundo em regiões tropicais e subtropicais. Apesar de seu alto valor madeireiro e sua importância ecológica, há pouco conhecimento científico sobre esta espécie, tais como sobre sua variabilidade genética, informações genômicas amplas, estrutura de programas de melhoramento genético e aptidão edafoclimática. O primeiro capítulo tem como objetivos: (i) inferir sobre a estrutura da variabilidade de caracteres quantitativos em procedências nativas de Toona ciliata introduzidas da Australia; (ii) realizar o zoneamento climático para T. ciliata no Brasil, visando dar subsídios quanto à alocação de plantios no país. Para as avaliações genéticas, 74 progênies de T. ciliata amostradas na Austrália foram trazidas ao Brasil e fenotipadas para altura total (m) e diâmetro (cm) em um ensaio de procedências e progênies. As avaliações foram realizadas em quatro idades após plantio e os dados foram ajustados com modelos lineares mistos para posterior estimação de parâmetros genéticos. Para o zoneamento climático, dados de ocorrência natural de T. ciliatana Australia foram utilizadas para treinamento de um modelo logístico utilizando 20 variáveis geoclimáticas do WorldClim como variáveis preditoras. A predição de T. ciliata em território brasileiro foi realizada sob as normais climáticas históricas (1970-2000) e preditas para três períodos futuros: 2021-2040; 2041-2060 e 2061-2080, utilizando o modelo preditivo de alterações climáticas. Os resultados das avaliações genéticas para caracteres quantitativos mostraram média a alta estruturação da variância quantitativa de T. ciliata entre procedências, com valores de Q_st variando de 0,14 a 0,23 para altura e diâmetro, respectivamente. As herdabilidade individuais no sentido restrito (h_a^2) estimadas para os dois caracteres foram moderadas (0,31 e 0,25, respectivamente). Os maiores ganhos de seleção foram obtidos para diâmetro enquanto os maiores valores de tamanho efetivo populacional N_e foram obtidos para altura. Quanto ao zoneamento climático, 65,1% do território brasileiro foi classificado como áreas de alta e boa aptidão de plantio de T. ciliata, com concentração de áreas de alta aptidão no norte e sul do Brasil, sendo que a precipitação (mm) foi a condição edafoclimática de maior influência na predição de aptidão. O segundo capítulo da tese teve o objetivo de identificar e caracterizar regiões microssatélites no genoma de T. ciliata. Para isso, sequências disponíveis no banco SRA-NCBI foram montadas em um rascunho do genoma da espécie. Essa montagem, apesar de altamente fragmentada, possibilitou a identificação de locos microssatélites com o software MISA (Microssatélite Identification Tool).Os locos foram, posteriormente, classificados quanto ao tipo, tamanho do motivo e número de repetições. No genoma de T. ciliata foram detectados 39.085locos SSR, sendo 32,3% mononucleotideos, 56,8% dinunucleotídeos, 7,9 % foram classificados entre tri-, tetra-, penta- e hexanucleotideos. Dinucleotideos com 10 e 11 repetições foram os locos com maior abundância e o tipo de motivo mais frequente foi o mononucleotudeo AT/AT, representando 42,8% do total de microssatélites. | pt_BR |
dc.publisher.department | Departamento de Biologia | pt_BR |
dc.subject.cnpq | Genética Vegetal | pt_BR |
dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/4425889504529858 | pt_BR |
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