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O Departamento de Engenharia (DEG) abrange os cursos de graduação em: Engenharia Agrícola; Engenharia de Controle e Automação; Engenharia Ambiental e Sanitária; Engenharia Civil; Engenharia de Materiais; Engenharia Mecânica e Engenharia Química. Abrange ainda os cursos de pós-graduação Stricto Sensu em: Engenharia Agrícola; Engenharia de Sistemas e Recursos Hídricos em Sistemas Agrícolas.

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