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http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/5317| Título: | Codificação e clustering de proteínas |
| Autor : | Araújo, Gustavo Figueiredo |
| Primeiro orientador: | Rodrigues, Thiago de Souza |
| Primeiro membro da banca: | Castro, Cristiano Leite de Pereira, Marluce Rodrigues |
| Área de concentração: | Bioinformática |
| Palavras-chave: | Codificação de proteínas Comparação de sequências Clustering de proteínas Coding of protein Comparing sequences Clustering of proteins |
| Data da defesa: | 17-Jan-2008 |
| Data da publicação: | 15-Abr-2015 |
| Referência: | ARAÚJO, G. F. Codificação e clustering de proteínas. 2007. 36 p. Monografia (Graduação em Ciência da Computação) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2007. |
| Resumo: | Este trabalho visa analisar o método de codificação de seqüências Sequence Coding by Sliding Window (SCSW) aplicado na codificação de seqüências de aminoácidos. Para realizar a avaliação do método, foi utilizado o algoritmo de clusterização K-Means, a fim de verificar a eficácia do método de codificação na comparação de similaridades entre seqüências. Apesar de levantados alguns problemas no método SCSW, os resultados mostraram que esse método pode ser útil na determinação de similaridade entre seqüências, entretanto estes problemas devem ser minimizados a fim de se obter melhores resultados. |
| Abstract: | This work aims to analyze the method of coding sequences called here Coding Sequence by Sliding Window (SCSW) applied in amino acids sequences. The K-Means clustering algorithm was used to verify the SCSW effectiveness comparing the similarities between the original sequences. The results showed that this method can be useful in determining the similarity between sequences, however some problems should be solved or minimized in order to obtain better results. |
| URI: | http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/5317 |
| Idioma: | pt_BR |
| Aparece nas coleções: | PROGRAD - Ciência da Computação (Trabalhos de Conclusão de Curso) |
Arquivos associados a este item:
| Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
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| MONOGRAFIA_Codificacao_e_clustering_de_proteinas.pdf | 999,03 kB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
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