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DCC - Bacharelado em Ciência da Computação (Monografias) >

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Título: O uso do algoritmo mbkm e da medida dkm em biblioteca de est
Autor(es): Rezende, Pâmela Marinho
Orientador: Chalfun Junior, Antonio
Membro da banca: Uchôa, Joaquim Quinteiro
Membro da banca: Brum, Christiane Noronha Fernandes
Assunto: Bioinformática
Alinhamento de sequências
Alinhamento por partição
Data de Defesa: 21-Out-2014
Data de publicação: 17-Dez-2015
Resumo: Neste trabalho foi utilizado o algoritmo mBKM (Modificação do algoritmo de K-média por Bisseção) juntamente com o algoritmo de medidas DMK (Medidas de Distancia baseadas em K-tuplas) extraído de Wei, Jiang, et al., (2012). Este algoritmo consiste em um método livre de alinhamentos para agrupamento hierárquico de sequências. Para gerar os agrupamentos do algoritmo foi utilizada a base de dados do NCBI e sequências de ESTs extraído de Fernandes (2011). O algoritmo foi implementado e testado com tamanhos de 10, 20, 30, 40 E 50 agrupamentos. Como resultados dos experimentos em geral demonstraram-se satisfatórios levando em consideração o critério estabelecido. Conclui-se então que através das implementações e modificações propostas por este trabalho o algoritmo apresentou bons agrupamentos para as sequências de café da progeniê Siriema.
Abstract: Não
URI: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/10727
Idioma: por
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