O uso do algoritmo mbkm e da medida dkm em biblioteca de est

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Título:	O uso do algoritmo mbkm e da medida dkm em biblioteca de est
Autor :	Rezende, Pâmela Marinho
Primeiro orientador:	Chalfun Junior, Antonio
Primeiro membro da banca:	Uchôa, Joaquim Quinteiro
Segundo membro da banca:	Brum, Christiane Noronha Fernandes
Palavras-chave:	Bioinformática Alinhamento de sequências Alinhamento por partição
Data da defesa:	21-Out-2014
Data da publicação:	17-Dez-2015
Resumo:	Neste trabalho foi utilizado o algoritmo mBKM (Modificação do algoritmo de K-média por Bisseção) juntamente com o algoritmo de medidas DMK (Medidas de Distancia baseadas em K-tuplas) extraído de Wei, Jiang, et al., (2012). Este algoritmo consiste em um método livre de alinhamentos para agrupamento hierárquico de sequências. Para gerar os agrupamentos do algoritmo foi utilizada a base de dados do NCBI e sequências de ESTs extraído de Fernandes (2011). O algoritmo foi implementado e testado com tamanhos de 10, 20, 30, 40 E 50 agrupamentos. Como resultados dos experimentos em geral demonstraram-se satisfatórios levando em consideração o critério estabelecido. Conclui-se então que através das implementações e modificações propostas por este trabalho o algoritmo apresentou bons agrupamentos para as sequências de café da progeniê Siriema.
Abstract:	Não
URI:	http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/10727
Idioma:	por
Aparece nas coleções:	PROGRAD - Ciência da Computação (Trabalhos de Conclusão de Curso)

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