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Título: Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease
Título Alternativo: Quantitative studies of correlation structure activity of peptides inhibiters of the HIV-1 protease
Autor(es): Souza, Thaís Cristina Silva de
Orientador: Cunha, Elaine Fontes Ferreira da
Membro da banca: Paiva, Luciano Vilela
Freitas, Matheus Puggina de
Área de concentração: Agroquímica
Assunto: AIDS
Protease
Inibidor peptídico
HIV-1
QSAR-5/6D
Protease
Peptide inhibitor
Data de Defesa: 9-Jul-2009
Data de publicação: 2013
Agência de Fomento: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Referência: SOUZA, T. C. S. de. Estudos quantitativos multidimensionais de correlação estrutura-atividade de inibidores peptídicos da HIV-1 protease. 2009. 100 p. Dissertação (Mestrado em Agroquímica)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2009.
Resumo: A AIDS é uma doença provocada por um vírus específico, que afeta o sistema de defesa imunológico. HIV-1 protease é um homodímero, que desempenha o papel de "tesoura molecular" ao clivar diversas poliproteínas não funcionais em proteínas menores e funcionais, de forma a produzir proteínas maduras. Segundo o último informativo da The Joint United Nations Programme on HIV/AIDS - UNAIDS (2009), estima-se que vivem com HIV/AIDS 34.000.000 de pessoas em todo o mundo. Estudos quantitativos de relação estrutura-atividade em 5D e 6D (QSAR-5D e 6D), de 46 inibidores peptídicos com grupamento diol vicinal central da HIV-1 protease, foram realizados usando QSAR-5D (RAPTOR, Receptor as Poly Tier Object Representation) e QSAR-6D (QUASAR, The quase-atomistic receptor modeling). Doze compostos, que não fizeram parte dos cálculos na etapa de geração dos modelos, foram usados para validar os métodos QSAR-5D e 6D. Os modelos de QSAR-5D e 6D foram gerados apenas utilizando a metodologia dos mínimos quadrados parciais. O melhor modelo do método QSAR-5D gerou valores de R2Treinamento e R2Teste iguais a 0,944 e 0,793, respectivamente. O melhor modelo do método QSAR-6D gerou valores de R2Treinamento e R2Teste iguais a 0,001 e 0,-0,040, respectivamente. Os métodos servirão, portanto, para mapear os sítios de interação da série de compostos em estudo e propor modificações estruturais com o objetivo de torná-los mais potentes e, conseqüentemente, melhores inibidores da HIV-1 protease.
AIDS is a disease provoked by a specific virus, which affects the immunologic defense system. HIV-1 protease is a homodimer, which plays the role of "molecular scissors" in cleaving several non-functional polyproteins into smaller and functional proteins in order to generate mature proteins. According to The Joint United Nations Programme on HIV/AIDS - UNAIDS (2009), latest informative, it is estimated that 34,000,000 persons live with HIV/AIDS all over the world. Quantitative studies of structure-activity relationship on 5D and 6D (QSAR-5D and 6D) of 46 peptide inhibitors with central vicinal diol grouping of HIV-1 protease, were performed by using QSAR-5D (RAPTOR, Receptor as Poly Tier Object Representation) and QSAR-6D (QUASAR, The quase-atomistic receptor modeling). Twelve compounds, which did not make part of the calculations at the step of generating the models, were used to validate the QSAR-5D and 6D methods. The QSAR-5D and 6D models were generated only by utilizing the partial least square methodology. The best model of the QSAR-5D method generated values of R2Training and R2Test equal to 0.944 and 0.793, respectively. The best model of the QSAR-6D method generated values of e R2Training and R2Test equal to 0.001 and 0.-0,040, respectively. Then, the methods will be useful to map the interaction sites of compounds under study and propose structural modifications with the objective of making them more potent and, consequently, better HIV-1 protease inhibitors.
Informações adicionais: Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agroquímica, área de concentração em Agroquímica, para a obtenção do título de Mestre.
URI: http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/1338
Publicador: UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
Idioma: pt_BR
Aparece nas coleções: DQI - Agroquímica - Mestrado (Dissertações)

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