1. RI UFLA
  2. Programas de Pós-Graduação - Teses e Dissertações
  3. Microbiologia Agrícola - Mestrado (Dissertações)
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dc.creatorFerreira, Julie Kennya de Lima-
dc.date.accessioned2021-10-04T20:45:47Z-
dc.date.available2021-10-04T20:45:47Z-
dc.date.issued2021-10-04-
dc.date.submitted2021-04-30-
dc.identifier.citationFERREIRA, J. K. de L. Prevalência do operon sfrAAABCD (surfactina) em Bacillus subtilis: uma análise pangenômica. 2021. 65 p. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agrícola) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2021.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/48311-
dc.description.abstractSurfactin is a lipopeptide biosurfactant commonly produced by Bacillus genus bacteria. However, its expression is dependent on several genetic factors of adaptation and communication. Gene prevalence studies are important to help the understanding of these interaction factors. This work aimed to evaluate the surfactin operon (sfrAABCD)’s prevalence in Bacillus subtilis strains, as well as the pangenomic repertoire of the species through comparative genomics. The complete genome of B. subtilis RI4914 was sequenced using a hybrid approach, with the PGM IonTorrent and the GridIONTM platforms. A total of 153 complete genomes classified as B. subtilis were retrieved from the NCBI for comparative study, from which the core genes were used for pangenome and MLST analyses. The genome obtained showed high quality and good accuracy, with completeness of 98.84% and contamination of 1.10%. The comparative genomics analysis showed the open pangenomic profile in B. subtilis and surfactin prevalence in all analyzed genomes, classifying it as a distinctive character of this species.pt_BR
dc.description.sponsorshipConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)pt_BR
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Lavraspt_BR
dc.rightsacesso abertopt_BR
dc.subjectGenômica comparativapt_BR
dc.subjectMontagem híbridapt_BR
dc.subjectSurfactinapt_BR
dc.subjectGridIONpt_BR
dc.subjectComparative genomicspt_BR
dc.subjectHybrid assemblypt_BR
dc.subjectSurfactinpt_BR
dc.titlePrevalência do operon sfrAAABCD (surfactina) em Bacillus subtilis: uma análise pangenômicapt_BR
dc.title.alternativePrevalence of the sfrAABCD operon (Surfactin) in Bacillus subtilis: a pangenomic analysispt_BR
dc.typedissertaçãopt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Microbiologia Agrícolapt_BR
dc.publisher.initialsUFLApt_BR
dc.publisher.countrybrasilpt_BR
dc.contributor.advisor1Pylro, Victor Satler-
dc.contributor.advisor-co1Batista, Cristina Ferreira Silva e-
dc.contributor.referee1Morais, Daniel Kumazawa-
dc.contributor.referee2Melo, Dirceu de Sousa-
dc.contributor.referee3Roesch, Luiz Fernando Wurdig-
dc.description.resumoA surfactina é um biossurfactante lipopeptídico comumente produzido por bactérias do gênero Bacillus. Entretanto, a sua expressão é dependente de vários fatores genéticos de adaptação e comunicação. Estudos de prevalência gênica têm se mostrado importantes para auxiliar o entendimento acerca desses fatores de interação. Nesse contexto, o trabalho teve por objetivo avaliar a prevalência do operon de surfactina (sfrAABCD) em estirpes de Bacillus subtilis, bem como o repertório pangenômico da espécie através da genômica comparativa. O genoma completo do B. subtilis RI4914 foi sequenciado por meio de abordagem híbrida, utilizando as plataformas PGM IonTorrent e GridIONTM. Para o estudo comparativo, 153 genomas completos, classificados como B. subtilis foram recuperados do NCBI, dos quais foram utilizados os genes core para análises de pangenoma e MLST. O genoma obtido apresentou alta qualidade e boa acurácia, com completude de 98,84% e contaminação de 1,10%. A análise de genômica comparativa evidenciou o perfil pangenômico aberto em B. subtilis e prevalência da surfactina em todos os genomas analisados, demonstrando-se como um caráter característico da espécie.pt_BR
dc.publisher.departmentDepartamento de Biologiapt_BR
dc.subject.cnpqMicrobiologia Agrícolapt_BR
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/9480575941316657pt_BR
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