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http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/10727
Título: | O uso do algoritmo mbkm e da medida dkm em biblioteca de est |
Autor : | Rezende, Pâmela Marinho |
Primeiro orientador: | Chalfun Junior, Antonio |
Primeiro membro da banca: | Uchôa, Joaquim Quinteiro |
Segundo membro da banca: | Brum, Christiane Noronha Fernandes |
Palavras-chave: | Bioinformática Alinhamento de sequências Alinhamento por partição |
Data da defesa: | 21-Out-2014 |
Data da publicação: | 17-Dez-2015 |
Resumo: | Neste trabalho foi utilizado o algoritmo mBKM (Modificação do algoritmo de K-média por Bisseção) juntamente com o algoritmo de medidas DMK (Medidas de Distancia baseadas em K-tuplas) extraído de Wei, Jiang, et al., (2012). Este algoritmo consiste em um método livre de alinhamentos para agrupamento hierárquico de sequências. Para gerar os agrupamentos do algoritmo foi utilizada a base de dados do NCBI e sequências de ESTs extraído de Fernandes (2011). O algoritmo foi implementado e testado com tamanhos de 10, 20, 30, 40 E 50 agrupamentos. Como resultados dos experimentos em geral demonstraram-se satisfatórios levando em consideração o critério estabelecido. Conclui-se então que através das implementações e modificações propostas por este trabalho o algoritmo apresentou bons agrupamentos para as sequências de café da progeniê Siriema. |
Abstract: | Não |
URI: | http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/10727 |
Idioma: | por |
Aparece nas coleções: | PROGRAD - Ciência da Computação (Trabalhos de Conclusão de Curso) |
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Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
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TCC_Implementação_de_um_sistema_para_monitoramento_de_rede_e_serviços.pdf | 1,72 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
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