dissertação
Validação de marcador molecular associado à resistência do feijoeiro comum a raça 65 de Colletotrichum Lindemuthianum
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Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
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Sociais
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Educação
Saúde
Tecnologia e produção
Meio ambiente
Saúde
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Meio ambiente
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ODS 1: Erradicação da pobreza
ODS 2: Fome zero e agricultura sustentável
ODS 3: Saúde e bem-estar
ODS 8: Trabalho decente e crescimento econômico
ODS 9: Indústria, inovação e infraestrutura
ODS 12: Consumo e produção responsáveis
ODS 13: Ação contra a mudança global do clima
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Dados abertos
Resumo
O controle genético da antracnose, causada pelo fungo Colletotrichum lindemuthianum, tem sido um desafio devido à grande variabilidade patogênica, entre e dentro das raças. Contudo, marcadores SNPs ligados a locos de resistência a diferentes isolados de C. lindemuthianum têm sido identificados e com potencial para utilização em programas de melhoramento do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). Nesse contexto, o objetivo do presente trabalho foi validar a associação do marcador SNP ss715649771 com a resistência ao isolado LV134 da raça 65. Para isto, foram realizadas avaliações fenotípicas e genotípicas em uma população F2 de 192 plantas, derivadas do cruzamento entre as cultivares BRS Cometa (suscetível) e BRSMG Ouro Vermelho (resistente), e também em um painel de 55 genótipos constituído de cultivares e linhagens elite de diferentes programas de melhoramento. Além disso, foi realizada uma análise de regressão linear do efeito do marcador e a eficiência de seleção (ES) para marcadores codominantes foi estimada. A fenotipagem da geração F2 resultou, como esperado, na proporção 3R:1S (p = 0,093), assim como a genotipagem também se ajustou a 1CC:2CT:1TT (p = 0,095). A frequência de recombinação da população F2 foi estimada em 10,0%, onde foram observadas 11 plantas com fenótipos recombinantes (4 resistentes com o alelo T, e 7 suscetíveis com alelo C). A estimativa de ES foi de 96%, e o modelo de regressão linear estatisticamente significativo, explicando cerca de 42% da variação. As análises com o painel de 55 genótipos revelaram 41% de indivíduos recombinantes (9 resistentes com o alelo T, e 14 suscetíveis com o alelo C). Considerando o alto valor de ES, os resultados do presente trabalho evidenciam o alto potencial de utilização desse marcador nas rotinas de Seleção Assistida por Marcadores. Contudo, a distância de 10cM entre a marca e o gene, e o número de indivíduos recombinantes observado no painel de cultivares podem sugerir a existência de outros alelos que conferem resistência à raça 65 nas cultivares avaliadas. A utilização do marcador SNPss715649771 em programas de melhoramento, junto a outras marcas já conhecidas, contribuirá para a piramidação de genes de resistência a esta raça em linhagens de feijoeiro comum.
Abstract
The genetic control of anthracnose, caused by Colletotrichum lindemuthianum fungus, has become a challenge due the great pathogenic variability among and within races. However, SNPs markers linked to resistance loci to different C. lindemuthianum isolates have been identified and have potential to be used in common bean breeding programs (Phaseolus vulgaris L.). In this context, the present study aimed to validate the SNP marker ss715649771 association with resistance to the isolate LV134 of race 65. For this, phenotypic and genotypic evaluations were carried out in an F2 population of 192 plants, derived from the cultivars BRS Cometa (susceptible) and BRSMG Ouro Vermelho (resistant) cross, and also in a 55 genotypes panel of cultivars and elite lines from different breeding programs. In addition, a linear regression analysis of the marker effect was carried out, and the selection efficiency (SE) for codominant markers was estimated. The generation F2 phenotyping resulted, as expected, in the 3R:1S ratio (p = 0.093), and the genotyping also adjusted to 1CC:2CT:1TT (p = 0.095). The recombination frequency of the F2 population was estimated at 10.0%, with 11 plants presenting recombinant phenotypes (4 resistant with T allele, and 7 susceptible with C allele). The estimated SE was 96%, and the linear regression model was statistically significant, explaining about 42% of the variation. The panel analyses of 55 genotypes revealed 41% of recombinant individuals (9 resistant with T allele, and 14 susceptible with C allele). Considering the high SE value, results shows a high potential use of this marker in Marker-Assisted Selection routines. However, the 10cM distance between the marker and the gene, and the number of recombinant individuals observed on the cultivars panel can suggest the existence of other alleles that confer resistance to race 65 in the evaluated cultivars. The use of the SNPss715649771 marker in breeding programs, together with other already known markers, will contribute to the pyramiding of resistance genes to this race in common bean lines.
Descrição
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Impacto da pesquisa
Resumen
ISBN
DOI
Citação
DIAS , Mariana Andrade. Validação de marcador molecular associado à resistência do feijoeiro comum a raça 65 de Colletotrichum Lindemuthianum. 2023. 55p. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2023.
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