dissertação
Caracterização da resposta de Gliricidia sepium (Jacq.) steud. ao estresse salino mediante emprego da proteômica e metabolômica
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Universidade Federal de Lavras
Faculdade, Instituto ou Escola
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Não especifica vinculação com nenhum departamento
Programa de Pós-Graduação
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal
Agência de fomento
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG)
Tipo de impacto
Áreas Temáticas da Extenção
Objetivos de Desenvolvimento Sustentável
Dados abertos
Resumo
A população mundial está aumentando rapidamente ao longo dos anos e será necessário produzir aproximadamente 90% a mais de culturas alimentares do que estamos produzindo hoje, especialmente grãos, para suprir tal demanda até 2050 (REDDY et al., 2017). No entanto, o estresse abiótico, que inclui o sal, ameaça severamente a produção agrícola e causa perdas significativa de rendimento em grandes áreas (OSAKABE; OSAKABE, 2012). Desta forma, o objetivo geral do presente estudo foi aplicar estratégias de análise do metabolôma e do proteôma de folhas e raízes de plantas jovens de Gliricidia sepium, submetidas ou não a alto nível de estresse salino (>25 dS m-1), visando adquirir conhecimentos sobre os mecanismos moleculares envolvidos na tolerância desta espécie à salinidade. Portanto, foram utilizados dados do banco de dados “Sal da Terra”, pertencentes ao programa de PD&I de mesmo nome desenvolvido na Embrapa Agroenergia, que abriga dados de fenômica, ionômica, genômica, transcritômica (mRNA e microRNA), metabolômica e proteômica caracterizando a resposta de dendê (Elaeis guineensis), beldroega (Portulaca oleracea) e gliricídia (Gliricidia sepium) ao estresse salino. As amostras de metaboloma foram analisadas em um sistema UHPLC equipado com uma coluna de fase reversa. A espectrometria de massa de alta resolução (HRMS) foi realizada em um analisador Q-TOF usando fonte de eletrospray em ESI (+) - MS e ESI (-) - MS. Os dados adquiridos foram pré-processados usando o XCMS Online e posteriormente exportados para o MetaboAnalyst para análises estatísticas, anotação e observação das vias metabólicas. As amostras de proteoma foram preparadas e submetidas a análises LC – MS/MS pela empresa GenOne (Rio de Janeiro, RJ, Brasil), utilizou uma abordagem de quantificação “label-free”, e os dados foram adquiridos usando o software Xcalibur e posteriormente exportados para o PatternLab para as análises quantitativas e qualitativas. Os resultados alcançados permitiram identificar proteínas e metabólitos, e vias metabólicas, responsivas a este estresse, tanto nas folhas quanto nas raízes.
Abstract
The world population is increasing rapidly over the years and it will be necessary to produce approximately 90% more food crops than we are producing today, especially grains, to meet this demand by 2050 (REDDY et al., 2017). However, abiotic stress, which includes salt, severely threatens agricultural production and causes significant yield losses in large areas (OSAKABE; OSAKABE, 2012). Thus, the general objective of the present study was applied to the analysis of the metabolome and proteome of leaves and roots of young plants of Gliricidia sepio, submitted or not to a high level of salt stress (> 25 dS m-1), before acquiring knowledge about the molecular mechanisms involved in this salinity tolerance. Therefore, data from the "Sal da Terra" database were used, belonging to the RD&I program of the same name developed at Embrapa Agroenergia, which houses data from physics, ionomics, genomics, transcriptomics (mRNA and microRNA), metabolomics and proteomics characterizing the response of oil palm (Elaeis guineensis), purslane (Portulaca oleracea) and gliricidia (Gliricidia sepium) to salt stress. How the metabolomes were analyzed on a UHPLC system equipped with a reversed phase column. High resolution mass spectrometry (HRMS) was performed on a Q-TOF analyzer using an electrospray source in ESI (+) - MS and ESI (-) - MS. The acquired data were pre-processed using XCMS Online and later exported to MetaboAnalyst for analysis, annotation and observation of metabolic pathways. Proteome Ame were prepared and submitted to LC - MS / MS analysis by the company GenOne (Rio de Janeiro, RJ, Brazil), using a "label-free" quantification approach, and the data were acquired using the Xcalibur software and subsequently exported to PatternLab for quantitative and qualitative analysis. The results achieved allowed to identify proteins and metabolites, and metabolic pathways, responsive to this stress, both in leaves and roots.
Descrição
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Agência de desenvolvimento
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Impacto da pesquisa
Resumen
Palavras-chave
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DOI
Citação
BRAGA, I. de O. Caracterização da resposta de Gliricidia sepium (Jacq.) steud. ao estresse salino
mediante emprego da proteômica e metabolômica. 2022. 92 p. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2022.
