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O uso do algoritmo mbkm e da medida dkm em biblioteca de est

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Ciência da Computação

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Áreas Temáticas da Extenção

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Resumo

Neste trabalho foi utilizado o algoritmo mBKM (Modificação do algoritmo de K-média por Bisseção) juntamente com o algoritmo de medidas DMK (Medidas de Distancia baseadas em K-tuplas) extraído de Wei, Jiang, et al., (2012). Este algoritmo consiste em um método livre de alinhamentos para agrupamento hierárquico de sequências. Para gerar os agrupamentos do algoritmo foi utilizada a base de dados do NCBI e sequências de ESTs extraído de Fernandes (2011). O algoritmo foi implementado e testado com tamanhos de 10, 20, 30, 40 E 50 agrupamentos. Como resultados dos experimentos em geral demonstraram-se satisfatórios levando em consideração o critério estabelecido. Conclui-se então que através das implementações e modificações propostas por este trabalho o algoritmo apresentou bons agrupamentos para as sequências de café da progeniê Siriema.

Abstract

Não

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