Modelo hierárquico generalizado normal assimétrico Bayesiano aplicado à análise genômica
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Universidade Federal de Lavras
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Departamento de Estatística
Programa de Pós-Graduação
Programa de Pós-Graduação em Estatística e Experimentação Agropecuária
Agência de fomento
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
Tipo de impacto
Áreas Temáticas da Extensão
Objetivos de Desenvolvimento Sustentável
Dados abertos
Resumo
Um ponto crucial da análise genômica é a seleção correta dos indivíduos geneticamente superiores
para características de importância econômica. Nessa dissertação investigamos a aplicação
do Modelo Hierárquico Generalizado (Assimétrico) Bayesiano (MHGB) ao problema da seleção
genômica ampla (GWS). Isto porque, em geral, os modelos de seleção genômica assumem
que os dados seguem uma distribuição normal, tornando-se pouco confiáveis quando isto não
ocorre. Há indícios de que o MHGB pode ser utilizado com vantagens em seleção genômica,
sempre que se identificar assimetrias na distribuição dos dados.
Abstract
A crucial point in genomic analysis is the correct selection of genetically superior individuals
for characters of economic importance. In this dissertation we study the application of the
Generalized Hierarchical Bayesian Model (MHGB) using the asymetric gaussian distribution
to the Genome wide Selection problem (GWS). The reasoning for this choice of modelling is to
challenge current models of GWS when they fail their assumptions and become less reliable. A
simulation study was carried to compare reference models to MHGB. Markers of actual SNPs
data where used to simulated phenotypes in different scenarios for number of genes and heritability,
as well as degrees of asymmetry in the error distribution. In symmetric scenarios MHGB
was almost as acurate as main reference methods GBLUP. When asymetry arises, MHGB accuracy
overtakes GBLUP and all other considered methods. There are evidence that MHGB
should be used with advantages in GWS, whenever asymmetries are identified in the data distribution.
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Citação
MATEUS, W. S. Modelo hierárquico generalizado normal assimétrico Bayesiano aplicado à análise genômica. 2020. 73 p. Dissertação (Mestrado em Estatística e Experimentação Agropecuária) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2020.
