dissertação
Explicit solvent modeling of NMR parameters of oximes in water and ionic liquids
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Universidade Federal de Lavras
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Departamento de Química
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Programa de Pós-Graduação em Agroquímica
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Tipo de impacto
Áreas Temáticas da Extenção
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Resumo
Este trabalho tem como objetivo empregar a dinâmica molecular e o cálculo teórico da RMN para investigar os efeitos teóricos e do solvente nos parâmetros de RMN das oximas, em uma abordagem QM / MM sequencial. Utilizando o software GROMACS, foi realizada uma simulação clássica de dinâmica molecular para a oxima 4-PAM e 3-F-4-PAM usando água e BMIM-BF4 como solventes com o campo de força OPLS. Posteriormente cálculos de dinâmica molecular quântica e RMN foram realizados para identificar o flúor da oxima de 3-F-4-PAM como sonda espectroscópica para o tratamento da intoxicação por OP, utilizando o software Gaussian 09, com a metodologia GIAO com o funcional híbrido B3LYP e a função de base 6-31G (d, p). Nesta linha, a partir de nossos cálculos, o uso de líquidos iônicos pode ser uma “ponte” razoável entre custo e precisão para a detecção de modelagem de agentes de contraste de RMN para compostos organofosforados inibidos por enzimas AChE.
Abstract
This work aims to employ the molecular dynamics and the theoretical calculation of NMR to investigate the theoretical and solvent effects on NMR parameters of oximes, in a sequential QM / MM approach. Using GROMACS software, a classic molecular dynamics simulation was performed for the 4-PAM oxime and 3-F-4-PAM using water and BMIM-BF4 as solvents using the OPLS form field. Subsequently calculations of quantum molecular dynamics and NMR were performed to identify the fluorine of 3-F-4-PAM oxime as a spectroscopic probe for the treatment of OP intoxication, using the Gaussian 09 software, with the methodology GIAO using the hybrid functional B3LYP and the basis set 6-31G(d,p). In this line, from our calculations, the use of ionic liquids can provide a reasonable trade-off between cost and accuracy for detection of modeling MRI contrast agents for AChE enzymes inhibited organophosphorus compounds.
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FARIA, J. A. de. Explicit solvent modeling of NMR parameters of oximes in water and ionic liquids. 2018. 69 p. Dissertação (Mestrado em Agroquímica)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2018.