TCC
Codificação e clustering de proteínas
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Resumo
Este trabalho visa analisar o método de codificação de seqüências Sequence Coding by Sliding
Window (SCSW) aplicado na codificação de seqüências de aminoácidos. Para realizar a
avaliação do método, foi utilizado o algoritmo de clusterização K-Means, a fim de verificar a
eficácia do método de codificação na comparação de similaridades entre seqüências. Apesar de
levantados alguns problemas no método SCSW, os resultados mostraram que esse método
pode ser útil na determinação de similaridade entre seqüências, entretanto estes problemas
devem ser minimizados a fim de se obter melhores resultados.
Abstract
This work aims to analyze the method of coding sequences called here Coding Sequence by
Sliding Window (SCSW) applied in amino acids sequences. The K-Means clustering algorithm
was used to verify the SCSW effectiveness comparing the similarities between the original
sequences. The results showed that this method can be useful in determining the similarity
between sequences, however some problems should be solved or minimized in order to obtain
better results.
Descrição
Área de concentração
Bioinformática
Agência de desenvolvimento
Palavra chave
Marca
Objetivo
Procedência
Impacto da pesquisa
Resumen
ISBN
DOI
Citação
ARAÚJO, G. F. Codificação e clustering de proteínas. 2007. 36 p. Monografia (Graduação em Ciência da Computação) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2007.
