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Marcadores moleculares associados ao teor de fibra e divergência genética em cana-de-açúcar

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Resumo

No Brasil, nos programas de melhoramento de instituições de pesquisa de cana-de-açúcar buscam-se cultivares de Saccharum spp. com características específicas para cada setor, como a indústria para produção de álcool e açúcar, cultivares para bioenergia, forrageiras e também para produção de cachaça artesanal, onde teor de fibra se torna uma característica relevante. O entendimento dos componentes relacionados a esta característica representa um grande avanço na seleção de materiais para este nicho da cadeia produtiva da cana-de-açúcar. Objetivou-se com esta pesquisa, buscar em bancos de dados, seqüências expressas de proteínas que estejam relacionadas aos teores de fibra em cana-de-açúcar, bem como caracterizar genótipos de Saccharum spp., utilizando marcadores moleculares do tipo SSR. Neste sentido foram usados 11 primers, os quais foram desenhados a partir de EST (expression sequence tag) do genoma da cana-de-açúcar, que foram testados em 21 cultivares e 2 espécies de cana-de-açúcar. Nenhum dos marcadores das proteínas analisadas puderam ser usados como um padrão para identificação de teor de fibra na cana-de-açúcar. Para a caracterização, foram utilizados 13 primers em 21 cultivares e 2 espécies de cana-de-açúcar. Pelo dendrograma obtido, foi observada a dissimilaridade entre as cultivares, caracterizando-as por meio dos primers utilizados. Foi possível detectar polimorfismo, o que permitiu estimar genótipos mais divergentes existentes no material estudado.

Abstract

In Brazilian improvement programs of sugar cane research institutions, Saccharum spp. cultivars with specific characteristics for each sector are sought, such as the industry for the production of alcohol and sugar, cultivars for bioenergy, fodder and also for the production of handmade cachaça, where the fiber content becomes a relevant characteristic. Understanding the components related to this characteristic represents a major advance in material selection for this niche of the sugar cane commodity chain. The objective of this research was to seek, in databases, expressed sequences of protein that are related to fiber contents in sugar cane, as well as characterize Saccharum spp. genotypes, using SSR molecular markers. In this context, 11 primers were used; they were designed from the EST (expression sequence tag) of the sugar cane genome, which were tested in 21 cultivars and 2 species of sugar cane. None of the markers of the analyzed proteins could be used as a standard for the identification of the fiber content in sugar cane. For the characterization, 13 primers in 21 cultivars and 2 species of sugar cane were used. By the obtained dendrogram, a dissimilarity was observed among cultivars, characterizing them through the used primers. It was possible to detect polymorphism, which allowed to estimate more divergent genotypes existing in the studied material.

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Área de concentração

Produção Vegetal

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Citação

ANDRADE, P. P. Marcadores moleculares associados ao teor de fibra e divergência genética em cana-de-açúcar. 2013. 92 p. Tese (Doutorado em Agronomia/Fitotecnia)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2013.

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