Uma metodologia para identificação de módulos formadores de sequências de proteínas mosaicas do trypanosoma cruzi a partir do proteoma do parasito utilizando a ferramenta blast

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dc.contributor.advisor1Rodrigues, Thiago de Souza
dc.contributor.referee1Toledo, Cláudio Fabiano Motta
dc.contributor.referee1Pereira, Marluce Rodrigues
dc.creatorGomes, André de Souza
dc.date.accessioned2015-03-19T21:11:48Z
dc.date.available2015-03-19T21:11:48Z
dc.date.issued2015-03-19
dc.date.submitted2008-11-18
dc.description.abstractThis paper proposed a methodology for the identifying component modules of Trypanosoma cruzi mosaic proteins sequences using BLAST. For the development of the methodology, MASP protein family was used and a set of default BLAST parameter values was initially applied. Afterwards, different combinations of parameter values were studied for result comparison, including those indicated in literature. The developed methodology proved to be efficient for the proposed objective, obtaining better results when non-default parameter values for E-value, low complexity region filter, initial word size and substitution were applied.pt_BR
dc.description.concentrationBioinformáticapt_BR
dc.description.resumoEste trabalho propôs uma metodologia de identificação de módulos formadores de sequências de proteínas mosaicas do Trypanosoma cruzi utilizando a ferramenta BLAST. Para o desenvolvimento da metodologia, foi utilizada a família MASP de proteínas e aplicado inicialmente o conjunto de valores padrão dos parâmetros da ferramenta. Posteriormente foram estudadas diferentes combinações de valores de parâmetros a fim de comparação de resultados, incluindo valores indicados pela literatura. A metodologia desenvolvida provou ser eficaz para o objetivo proposto, obtendo melhores resultados quando aplicados valores diferentes dos valores padrão para E-value, filtro de regiões de baixa complexidade, tamanho inicial de palavra e matriz de substituição.pt_BR
dc.identifier.citationGOMES, A. de S. Uma metodologia para identificação de módulos formadores de sequências de proteínas mosaicas do trypanosoma cruzi a partir do proteoma do parasito utilizando a ferramenta blast. 2008. 47 p. Monografia (Graduação em Ciência da Computação) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2008.pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufla.br/handle/1/5256
dc.languagept_BRpt_BR
dc.rightsacesso abertopt_BR
dc.subjectBioinformáticapt_BR
dc.subjectProteínas mosaicaspt_BR
dc.subjectTrypanosoma cruzipt_BR
dc.subjectProteomapt_BR
dc.subjectBLASTpt_BR
dc.subjectBioinformaticspt_BR
dc.subjectMosaic proteinspt_BR
dc.subjectProteomept_BR
dc.titleUma metodologia para identificação de módulos formadores de sequências de proteínas mosaicas do trypanosoma cruzi a partir do proteoma do parasito utilizando a ferramenta blastpt_BR
dc.typeTCCpt_BR

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