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A importância das camadas orgânicas para avaliação e preservação da diversidade microbiana dos solos tropicais

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Resumo

A microbiota das camadas orgânicas (folhas em diferentes estágios de decomposição e húmus) dos solos florestais da Amazônia representa uma comunidade ainda pouco conhecida. Sabe-se que a mudança do uso do solo altera a diversidade e composição dos microrganismos desse sistema, mas até o momento, pouco se conhece acerca dos impactos sobre os microrganismos associados às camadas orgânicas. Considerando que essas camadas abrigam elevada diversidade de microrganismos na floresta e sua perda com a conversão floresta-pastagem resulta, consequentemente, em perda de diversidade, este estudo investigou a riqueza e diversidade de bactérias, fungos e fungos micorrízicos arbusculares (FMA) contidas nas camadas orgânicas e também no solo mineral de uma floresta e uma pastagem na Amazônia, por meio do sequenciamento dos amplicons 16S rRNA, ITS e 18S rRNA, respectivamente. Para avaliar a funcionalidade das comunidades presentes, quantificou-se genes funcionais envolvidos no ciclo do N através de qPCR (fixadores de N2, AOB, AOA e desnitrificadores). Foram coletadas camadas em diferentes estágios de decomposição da matéria orgânica de uma floresta (camada composta por folhas inteiras – L, fragmentadas – F, húmus - H e o solo mineral) e de uma pastagem (camadas L, F, solo mineral e rizosférico) no Pará, Brasil. Avaliando a diversidade das camadas orgânicas e do solo mineral em conjunto, a diversidade alfa de bactérias e fungos foi maior na pastagem e de FMA não foi alterada. Para diversidade beta, as camadas orgânicas foram essenciais para diferenciar os sistemas de uso do solo. A composição das comunidades de bactérias, fungos totais e FMA diferiram entre as camadas orgânicas e o solo mineral, mas também entre os dois sistemas, floresta e pastagem. Os grupos funcionais do ciclo do N (exceto AOB) foram mais abundantes na camada F da pastagem. Esses grupos foram abundantes no horizonte H da floresta e, assim como na pastagem, AOB também foi abundante nas camadas de folhas L e F. Em conjunto, esses resultados destacam as camadas orgânicas como um compartimento de alta diversidade microbiana e de potencial relevância para o ciclo do N não só em ambiente florestal, mas também em pastagem.

Abstract

The microbiota of organic layers (leaves in different stages of decomposition and humus) of Amazonian forest soils represent a community that is still little known. It is known that the change in land use alters the diversity and composition of microorganisms in this system, but so far, little is known about the impacts on microorganisms associated with organic layers. These layers harbor the diversity of microorganisms in the forest and their loss with the forest-pasture conversion results, consequently, in a loss of diversity. This study investigated the richness and diversity of bacteria, fungi and arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) contained in organic soil and also in mineral from a forest and pasture in the Amazon, by sequencing 16S rRNA, ITS and 18S rRNA amplicons, respectively. To assess the functionality of the communities present, genes affected in the N cycle were quantified by qPCR (N2 fixers, AOB, AOA and denitrifiers). Layers at different stages of organic matter decomposition were collected from a forest (layer composed of whole leaves - L, fragmented - F, humus - H and mineral soil) and from a pasture (layers L, F, mineral and rhizospheric soil) in the state of Pará, Brazil. Assessing the diversity of organic layers and mineral soil together, the diversity of bacteria and fungi was greater in the pasture and the AMF were not altered. For beta diversity, organic layers were essential to differentiate land use systems. Bacterial, total fungal and AMF communities differed between organic layers and mineral soil, but also between the two systems, forest and pasture. The adaptive groups of the N cycle (except AOB) were more abundant in the F layer of the pasture. These groups were abundant in the H horizon of the forest and, like in the pasture, AOB was also abundant in the L and F leaf layers. Together, these results highlight how the organic layers are a site of high microbial diversity and separate potential for the cycle of N, not only in a forest environment, but also in a pasture.

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DINIZ, P. P. A importância das camadas orgânicas para avaliação e preservação da diversidade microbiana dos solos tropicais. 2021. 146 p. Tese (Doutorado em Microbiologia Agrícola) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2021.

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