dissertação
Variabilidade genética dentro da raça 65 de Colletotrichum lindemuthianum por meio de marcadores RAPD e grupos de anastomoses
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UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
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DBI - Departamento de Biologia
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Resumo
O Colletotrichum lindemuthianum, agente causal da antracnose do feijoeiro, apresenta uma ampla variabilidade patogênica e genética, o que tem dificultado o desenvolvimento de cultivares resistentes. Este trabalho teve como objetivo estudar a variabilidade dentro da raça 65, por meio de marcadores RAPD e grupos de anastomoses. Foram utilizados 13 isolados pertencentes à raça 65, coletados em diferentes locais, hospedeiros e anos. Para análise de marcadores RAPD, foram utilizados 24 primers que amplificaram um total de 83 bandas polimórficas. Utilizando o coeficiente de Sorensen-Dice, obtiveram-se as estimativas das similaridades genéticas, que variaram de 0,54 a 0,82. O dendograma obtido pela análise de agrupamento permitiu identificar 11 grupos. As análises de anastomoses foram realizadas considerando compatíveis os isolados que formavam as anastomoses entre as hifas de isolados diferentes. Foram estimadas as proporções de reações compatíveis para cada isolado, bem como a análise de agrupamento, utilizando as estimativas de similaridade obtidas pelo coeficiente de Russel e Rao. As estimativas variaram de 0,28 a 0,85. No dendograma foi possível classificar 11 grupos de anastomoses, tendo apenas os isolados LV 61, LV 73 e LV 58 sido classificados em um mesmo grupo de anastomose, apesar de geneticamente distintos pela análise de RAPD. Ambas as análises permitiram demonstrar a grande variabilidade existente dentro da raça 65.
The causal agent of common bean anthracnose, Colletotrichum lindemuthianum, presents a wide genetic and pathogenic variability that has complicated the development of resistant cultivars. The aim of this study was to identify the variability within race 65 by RAPD markers and anastomosis groups. Thirteen isolates from race 65 collected in different counties, host cultivars and years were used. Twenty-four RAPD primers were used and amplified 83 polymorphic bands. The estimates of genetic similarities were obtained by Sorence-Dice´s coefficient and ranged from 0.54 to 0.82. The dendrogram obtained by cluster analysis allowed to identify eleven groups. The anastomosis analyses were carried out considering as compatible when fusion of hyphae from the paired of isolates was observed. The proportion of compatible reactions for each isolate was estimated. Cluster analysis was obtained by similarity estimates using Russel and Rao´coefficient. Similarity estimates range from 0.28 to 0.85. Eleven groups of anastomosis were obtained and only the isolates LV 61, LV 73 e LV 58 were classified in the same anastomosis group, although these isolates were genetically distinct by RAPD analysis. Both analyses allowed to demonstrate the great variability within the race 65.
The causal agent of common bean anthracnose, Colletotrichum lindemuthianum, presents a wide genetic and pathogenic variability that has complicated the development of resistant cultivars. The aim of this study was to identify the variability within race 65 by RAPD markers and anastomosis groups. Thirteen isolates from race 65 collected in different counties, host cultivars and years were used. Twenty-four RAPD primers were used and amplified 83 polymorphic bands. The estimates of genetic similarities were obtained by Sorence-Dice´s coefficient and ranged from 0.54 to 0.82. The dendrogram obtained by cluster analysis allowed to identify eleven groups. The anastomosis analyses were carried out considering as compatible when fusion of hyphae from the paired of isolates was observed. The proportion of compatible reactions for each isolate was estimated. Cluster analysis was obtained by similarity estimates using Russel and Rao´coefficient. Similarity estimates range from 0.28 to 0.85. Eleven groups of anastomosis were obtained and only the isolates LV 61, LV 73 e LV 58 were classified in the same anastomosis group, although these isolates were genetically distinct by RAPD analysis. Both analyses allowed to demonstrate the great variability within the race 65.
Abstract
Descrição
Área de concentração
Genética e Melhoramento de Plantas
Agência de desenvolvimento
Palavra chave
Marca
Objetivo
Procedência
Impacto da pesquisa
Resumen
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DOI
Citação
ISHIKAWA, F. H. Variabilidade genética dentro da raça 65 de Colletotrichum lindemuthianum por meio de marcadores RAPD e grupos de anastomoses. 2006. 52 p. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2006.