Variabilidade genética na região its do rDNA de isolados de trichoderma spp. (Biocontrolador) e Fusarium oxysporum f. sp. Chrysanthemi

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dc.creatorMenezes, Josiane Pacheco
dc.creatorLupatini, Manoeli
dc.creatorAntoniolli, Zaida Inês
dc.creatorBlume, Elena
dc.creatorJunges, Emanuele
dc.creatorManzoni, Clarice G.
dc.date2010-02-01
dc.date.accessioned2015-04-30T13:35:38Z
dc.date.available2015-04-30T13:35:38Z
dc.date.issued2015-04-30
dc.description.abstractThe analysis of morphological and cultural characteristics may not enough for the characterization of the species of Trichoderma and Fusarium. The aim of this work was to characterize the Internal Transcribed Spacer (ITS) region of the rDNA of UFSMT15.1, UFSMT16 and UFSMT17 isolates of Trichoderma spp. used in the biocontrol of Fusarium oxysporum f. sp. chrysanthemi UFSMF6. DNA extraction of each isolate was accomplished starting from hyphae produced in liquid medium Potato-Dextrose-Agar. The samples of genomic DNA were submitted to the Polymerase Chain Reaction (PCR) with the primers ITS1 and ITS4, and the product was sequenced. The fragments generated from PCR amplification were digested with the restriction enzymes HaeIII, HinfI and MboI. The ITS region of the Trichoderma's isolates UFSMT15.1, UFSMT16 and UFSMT17 and the Fusarium UFSMF6 isolate showed a simple band with a fragment with 600 base pairs (bp) approximately. The restriction enzymes HaeIII, HinfI and MboI generated band polymorphism among the isolates. The isolates UFSMT15.1, UFSMT16, UFSMT17 and UFSMF6 showed high similarity whit Trichoderma koningiopsis, Hypocrea virens, Hypocrea lixii and Fusarium oxysporum species, respectively.
dc.description.resumoA análise de características morfológicas e culturais podem não ser suficientes para uma caracterização precisa das espécies de Trichoderma e Fusarium. Objetivou-se, neste trabalho, caracterizar a região do Espaço Interno Transcrito (ITS) do rDNA dos isolados UFSMT15.1, UFSMT16 e UFSMT17 de Trichoderma spp. utilizados no biocontrole de Fusarium oxysporum f. sp. chrysanthemi (isolado) UFSMF6. A extração de DNA de cada isolado foi realizada a partir de micélio produzido em meio líquido Batata-Dextrose. As amostras de DNA genômico foram submetidas à Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) com os oligonucleotídeos iniciadores universais ITS1 e ITS4 e o produto gerado foi sequenciado. Os fragmentos gerados pela amplificação da PCR foram tratados com as enzimas de restrição HaeIII, HinfI e MboI. As regiões ITS1, ITS2 e 5.8S do rDNA desses isolados fúngicos foram amplificadas com sucesso. A região ITS dos isolados UFSMT15.1, UFSMT16 e UFSMT17 de Trichoderma e o isolado UFSMF6 de Fusarium apresentaram uma banda simples com um fragmento de aproximadamente 600 pares de base (pb). As enzimas de restrição HaeIII, HinfI e MboI geraram polimorfismo de bandas entre os isolados. Com base nas análises da sequência de DNA, os isolados UFSMT15.1, UFSMT16, UFSMT17 e UFSMF6 apresentaram maior similaridade com as espécies Trichoderma koningiopsis, Hypocrea virens, Hypocrea lixii e Fusarium oxysporum, respectivamente.
dc.formattext/html
dc.identifierhttp://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542010000100017
dc.identifier.citationMENEZES, J. P. et al. Variabilidade genética na região its do rDNA de isolados de trichoderma spp. (Biocontrolador) e Fusarium oxysporum f. sp. Chrysanthemi. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 34, n. 1, p. 132-139, jan./fev. 2010.
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufla.br/handle/1/7155
dc.publisherEditora da Universidade Federal de Lavras
dc.sourceCiência e Agrotecnologia v.34 n.1 2010
dc.subjectFungos de solo
dc.subjectCaracterização molecular
dc.subjectSequências
dc.subjectEndonucleases
dc.subjectAnálises de DNA
dc.subjectMolecular characterization
dc.subjectSequences
dc.subjectDNA analysis
dc.titleVariabilidade genética na região its do rDNA de isolados de trichoderma spp. (Biocontrolador) e Fusarium oxysporum f. sp. Chrysanthemi
dc.title.alternativeGenetic variability in rDNA ITS region of Trichoderma spp. (biocontrole agent) and Fusarium oxysporum f. sp. chrysanthemi isolates
dc.typejournal article

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