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Analysis of the molecular diagnosis by polymerase chain reaction (pcr) of asymptomatic canine infection by Leishmania infantum

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Universidade Federal de Lavras

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Escola de Ciências Agrárias de Lavras (ESAL)

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Departamento de Medicina Veterinária

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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ODS 3: Saúde e bem-estar
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Resumo

A leishmaniose visceral é uma zoonose de elevada relevância em saúde pública, com ampla distribuição geográfica e impacto crescente em áreas urbanas e periurbanas. O cão doméstico desempenha papel central na manutenção do ciclo de transmissão da L. infantum, sobretudo em contextos endêmicos, nos quais infecções assintomáticas são frequentes e epidemiologicamente relevantes. Nesse cenário, o diagnóstico preciso desses animais representa um dos principais desafios para as estratégias de vigilância e controle da doença. Métodos sorológicos, amplamente utilizados em programas oficiais, apresentam limitações importantes relacionadas à sensibilidade em fases iniciais da infecção, à variabilidade da resposta imune e à ocorrência de reações cruzadas, especialmente em cães assintomáticos. Diante dessas limitações, técnicas moleculares baseadas na reação em cadeia da polimerase (PCR) têm sido amplamente investigadas como ferramentas mais robustas para diagnóstico da leishmaniose visceral canina. O presente trabalho teve como objetivo consolidar evidências sobre a real acurácia diagnóstica de métodos de PCR para identificação de cães assintomáticos com leishmaniose visceral por meio de revisão sistemática e metanálise, conforme diretrizes metodológicas estabelecidas. Especificamente, buscou-se: (1) estabelecer um referencial teórico abordando aspectos epidemiológicos da leishmaniose visceral, a importância do cão como reservatório, e as principais limitações dos métodos diagnósticos; (2) realizar metanálise a acurácia diagnóstica das técnicas de PCR em cães assintomáticos; e (3) desenvolver e validar in silico primers específicos para L. infantum direcionados aos genes HSP60, CPB e G3PD. Para a revisão sistemática e metanálise foram incluídos13 estudos. A análise verificou que a qPCR apresentou especificidade de 65,6%, e sensibilidade de 90,1% enquanto a PCR convencional declarou especificidade de 92,5% com sensibilidade de 75,3%. A acurácia global foi de 77,3% (IC95%: 65,1-86,2) com heterogeneidade substancial. O tipo de amostra e os primers utilizados não influenciaram significativamente o desempenho. A análise de risco de viés revelou fragilidades metodológicas relevantes entre os estudos incluídos. Quanto ao desenho de primers, as sequências genômicas foram selecionadas no TriTrypDB. Análises termodinâmicas por OligoAnalyser, e avaliações de especificidade in silico por Primer-BLAST confirmaram alinhamentos preferenciais com L. infantum e múltiplos polimorfismos em espécies não-alvo, indicando baixa probabilidade de amplificação cruzada. Os resultados reforçam que as técnicas de PCR constituem ferramentas relevantes para o diagnóstico da infecção canina assintomática por L. infantum. Contudo, a incorporação dessas técnicas aos programas de controle depende da padronização metodológica, da validação em diferentes cenários epidemiológicos e da integração entre abordagens moleculares, sorológicas e analíticas.

Abstract

Visceral leishmaniasis is a zoonotic disease of high relevance to public health, with widespread geographical distribution and increasing impact in urban and periurban areas. The domestic dog plays a central role in maintaining the transmission cycle of Leishmania infantum, particularly in endemic contexts, where asymptomatic infections are frequent and epidemiologically relevant. In this scenario, accurate diagnosis of these animals represents one of the main challenges for disease surveillance and control strategies. Serological methods, widely used in official programs, present important limitations related to sensitivity in early phases of infection, variability of immune response, and the occurrence of cross-reactions, especially in asymptomatic dogs. Given these limitations, molecular techniques based on polymerase chain reaction (PCR) have been extensively investigated as more robust diagnostic tools for canine visceral leishmaniasis. The present work aimed to consolidate evidence on the true diagnostic accuracy of PCR methods for identifying asymptomatic dogs with visceral leishmaniasis through a systematic review and meta-analysis, according to established methodological guidelines. Specifically, this study sought to: (1) establish a theoretical framework addressing epidemiological aspects of visceral leishmaniasis, the importance of dogs as reservoirs, and the main limitations of current diagnostic methods; (2) conduct a meta-analysis of the diagnostic accuracy of PCR techniques in asymptomatic dogs; and (3) design and validate in silico primers specific for L. infantum targeting the HSP60, CPB, and G3PD genes. For the systematic review and meta-analysis, 13 studies were included. The analysis showed that qPCR presented sensitivity of 90.1% and specificity of 65.6%, while conventional PCR demonstrated specificity of 92.5% with sensitivity of 75.3%. Overall diagnostic accuracy was 77.3% (95% CI: 65.1- 86.2) with substantial heterogeneity. Sample type and primers used did not significantly influence performance. Risk of bias analysis revealed relevant methodological weaknesses among included studies. Regarding primer design, genomic sequences were selected from TriTrypDB. Thermodynamic analyses by OligoAnalyzer and in silico specificity assessments by Primer-BLAST confirmed preferential alignments with L. infantum and multiple polymorphisms in non-target species, indicating low probability of cross-amplification. The results underscore that PCR techniques constitute relevant tools for diagnosing asymptomatic canine infection by L. infantum. However, the incorporation of these techniques into control programs depends on methodological standardization, validation in different epidemiological scenarios, and integration of molecular, serological, and analytical approaches.

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Sanidade animal e saúde coletiva

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PEREIRA, Jaqueline Aparecida Sousa. Analysis of the molecular diagnosis by polymerase chain reaction (pcr) of asymptomatic canine infection by Leishmania infantum. 2026. 112 p. Dissertação (Mestrado em Ciências Veterinárias) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2025.

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