Desenvolvimento e otimização de protocolos de PCR em tempo real para o diagnóstico de patógenos emergentes para a aquicultura nacional

Página do item simplificado
dc.contributor.advisor-coMian, Gláucia Frasnelli
dc.contributor.advisor1Figueiredo, Henrique César Pereira
dc.contributor.referee1Leite, Rômulo Cerqueira
dc.contributor.referee1Paiva, Luciano Vilela
dc.contributor.referee1Andrade, Thales Passos
dc.creatorLeal, Carlos Augusto Gomes
dc.date.accessioned2014-01-28T19:32:18Z
dc.date.available2014-01-28T19:32:18Z
dc.date.copyright2014
dc.date.issued2011-12-16
dc.date.submitted2014
dc.descriptionTese apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Ciências Veterinárias, área de concentração em Sanidade de Animais Aquáticos, para obtenção do título de Doutor.pt_BR
dc.description.abstractOutbreaks of infectious diseases are one of the main problems for national aquaculture development. The WSSV and IHHNV viruses, and streptococcal agents have been considered emergent pathogens for Brazilian shrimp, and tilapia farming, respectively. Fast, accurate and sensible diagnostic tools are fundamental for the control of diseases and biosecurity programs. The real-time PCR is a technology which has those characteristics, being an alternative. The aims of this project were: to standard and optimize qPCR assays with hydrolyze probes, containing non fluorescent quencher, for detection of WSSV and IHHNV; to develop a duplex qPCR to detect co-infection cases of WSSV and IHHNV in cultivated whiteleg shrimp (Litopenaeus vannamei); and to develop a duplex qPCR to diagnose Streptococcus agalactiae and Streptococcus dysgalactiae infections in Nile tilapia (Oreochromis niloticus). The use of non fluorescent quenched probe improved significantly the clinical sensitivity of qPCR for WSSV detection. WSSV and IHHNV co-infection cases were successfully diagnosed with the duplex qPCR standardized. The developed duplex qPCR for S. agalactiae and S. dysgalactiae diagnosis presented higher clinical sensitivity than bacteriological assay and PCR. qPCR showed superior performances than other methods used to diagnose those pathogens. The qPCR assays described in the present work showed to be valuable alternatives to diagnose the emergent pathogens for Brazilian aquaculture.
dc.description.concentrationSanidade de Animais Aquáticospt_BR
dc.description.resumoA ocorrência de surtos de doenças infecciosas tem se caracterizado como um dos principais entraves para a aquicultura nacional. Dentre os patógenos emergentes destacam-se os vírus WSSV e IHHNV, para carcinicultura e as bactérias do gênero Streptococcus, para tilapicultura. O diagnóstico rápido, acurado e sensível desses agentes é fundamental para os programas de controle, sendo a PCR em tempo real (qPCR) uma técnica que satisfaz essas premissas. O presente projeto foi realizado com os objetivos de: padronizar e otimizar protocolos qPCR com sondas de hidrólise, contendo "quencher" não fluorescente, para a detecção dos vírus WSSV e IHHNV; desenvolver uma qPCR duplex para a detecção de casos de coinfecção pelos vírus WSSV e IHHNV em camarão cultivado (Litopenaeus vannamei) e desenvolver uma qPCR duplex para o diagnóstico de Streptococcus agalactiae e Streptococcus dysgalactiae patogênicos para tilápia-do-nilo (Oreochromis niloticus). As sondas de hidrólise contendo "quencher" não fluorescente aumentaram significativamente a sensibilidade clínica da qPCR para o diagnóstico de WSSV. O diagnóstico de casos de coinfecção pelos vírus WSSV e IHHNV foi realizado com sucesso com o uso da qPCR duplex. A qPCR duplex desenvolvida para o diagnóstico de Streptococcus agalactiae e Streptococcus dysgalactiae apresentou maior sensibilidade clínica que métodos microbiológicos e PCR. O uso da qPCR mostrou-se viável e com resultados superiores aos das demais técnicas utilizadas. As reações descritas no presente trabalho são uma alternativa valiosa para o diagnóstico de patógenos emergentes para a aquicultura nacional.pt_BR
dc.identifier.citationLEAL, C. A. G. Desenvolvimento e otimização de protocolos de PCR em tempo real para o diagnóstico de patógenos emergentes para a aquicultura nacional. 2011. 92 p. Tese (Doutorado em Ciências Veterinárias) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2011.pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufla.br/handle/1/1594
dc.languagept_BRpt_BR
dc.publisherUNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRASpt_BR
dc.publisher.countryBRASILpt_BR
dc.publisher.initialsUFLApt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Ciências Veterináriaspt_BR
dc.rightsacesso abertopt_BR
dc.subjectAquiculturapt_BR
dc.subjectDoenças transmissíveis - Diagnósticopt_BR
dc.subjectReação em cadeia de polimerasept_BR
dc.subjectAquaculturept_BR
dc.subjectDiagnosispt_BR
dc.subjectCommunicable diseasespt_BR
dc.subjectPolymerase chain reactionpt_BR
dc.subjectPCr em tempo realpt_BR
dc.subject.cnpqCNPQ_NÃO_INFORMADOpt_BR
dc.titleDesenvolvimento e otimização de protocolos de PCR em tempo real para o diagnóstico de patógenos emergentes para a aquicultura nacionalpt_BR
dc.title.alternativeDevelopment and optimization of real-time PCR protocols for the diagnosis of emerging pathogens for Brazilian aquaculturept_BR
dc.typetesept_BR

Arquivos

Pacote original

Agora exibindo 1 - 1 de 1
Imagem de Miniatura
Nome:
TESE_Desenvolvimento e otimização de protocolos de PCR em tempo real para o diagnóstico de patógenos emergentes para a aquicultura nacional.pdf
Tamanho:
409.74 KB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Baixar

Licença do pacote

Agora exibindo 1 - 1 de 1
Imagem de Miniatura
Nome:
license.txt
Tamanho:
953 B
Formato:
Item-specific license agreed upon to submission
Descrição:
Baixar

Coleções

Ciências Veterinárias - Doutorado (Teses)