dissertação
Estabelecimento de controles positivos para diagnose de bactérias fitopatogênicas por PCR
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Título da Revista
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Editor
Universidade Federal de Lavras
Faculdade, Instituto ou Escola
Escola de Ciências Agrárias de Lavras (ESAL)
Departamento
Departamento de Fitopatologia
Programa de Pós-Graduação
Programa de Pós-Graduação em Agronomia/Fitopatologia
Agência de fomento
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Tipo de impacto
Áreas Temáticas da Extensão
Objetivos de Desenvolvimento Sustentável
Dados abertos
Resumo
O agronegócio vem exigindo cada vez mais competitividade, redução dos custos e aumento de qualidade de produtos e serviços, com consequências óbvias na área da fitopatologia, levando-se em consideração o risco dos prejuízos causados pelos patógenos. Para se evitar que isso aconteça, a diagnose precoce torna-se indispensável. Na diagnose de fitobactérias, considerando a amplitude de metodologias disponíveis, a tendência atual é de se utilizar uma abordagem múltipla, ou seja, fazer convergir as técnicas de forma a tornar os resultados complementares. Com o avanço das técnicas moleculares, a reação em cadeia da polimerase (PCR) tem permitido a detecção precoce de patógenos, antes mesmo do surgimento dos sintomas na planta, de forma mais rápida, fácil e com um alto nível de sensibilidade, se comparada aos métodos tradicionais, de diagnose e identificação. Uma das maiores limitações para o desenvolvimento dessa técnica é a falta de controles positivos, para checar a confiabilidade do teste empregado, pois sempre existe a possibilidade de obtenção de falso negativos e/ou falso positivos. Este trabalho teve como objetivo estabelecer controles positivos para bactérias fitopatogênicas, por meio da clonagem de fragmentos de DNA para serem empregados em diagnose por PCR. Foram clonados fragmentos genômicos de 6 bactérias, os clones se apresentaram como controles positivos confiáveis para serem empregados na diagnose por PCR das respectivas bactérias.
Agribusiness has demanded increasingly more competitive, reduce costs and increase quality of products and services, with obvious consequences in the field of plant pathology, taking into consideration the loss risk caused by pathogens. To prevent this, the early diagnosis is indispensable. In diagnosis of phyto-bacteria considering the extent available methodologies, the current trend is to use a multiple approach, in other words, converge techniques in order to make the complementary results. With advances in molecular techniques, the polymerase chain reaction (PCR) has allowed early pathogens detection, even before the onset symptoms in the plant, more quickly, easily and with a high sensitivity level, compared to traditional methods of diagnosis and identification. One of the major constraints to the development this technique is the lack of positive controls to check the reliability of the test used, because there is always the possibility of obtaining false negative and/or false positives. This study had as objective established positive controls for plant pathogenic bacteria through the cloning of DNA fragments to be used in PCR diagnosis. There were cloned genomic fragments from 6 bacteria, clones presented as reliable positive controls to be used in PCR diagnosis of the respective bacteria.
Agribusiness has demanded increasingly more competitive, reduce costs and increase quality of products and services, with obvious consequences in the field of plant pathology, taking into consideration the loss risk caused by pathogens. To prevent this, the early diagnosis is indispensable. In diagnosis of phyto-bacteria considering the extent available methodologies, the current trend is to use a multiple approach, in other words, converge techniques in order to make the complementary results. With advances in molecular techniques, the polymerase chain reaction (PCR) has allowed early pathogens detection, even before the onset symptoms in the plant, more quickly, easily and with a high sensitivity level, compared to traditional methods of diagnosis and identification. One of the major constraints to the development this technique is the lack of positive controls to check the reliability of the test used, because there is always the possibility of obtaining false negative and/or false positives. This study had as objective established positive controls for plant pathogenic bacteria through the cloning of DNA fragments to be used in PCR diagnosis. There were cloned genomic fragments from 6 bacteria, clones presented as reliable positive controls to be used in PCR diagnosis of the respective bacteria.
Abstract
Descrição
Dissertação apresentada à Universidade Federal e Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Agronomia, área de concentração em Fitopatologia, para a obtenção do título de Mestre.
Área de concentração
Fitopatologia
Linha de pesquisa
Agência de desenvolvimento
Palavra chave
Marca
Objetivo
Procedência
Impacto da pesquisa
Resumen
Palavras-chave
ISBN
DOI
Citação
SILVA, G. M. da. Estabelecimento de controles positivos para diagnose de bactérias fitopatogênicas por PCR. 2012. 52 p. Dissertação (Mestrado em Fitopatologia)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2012.