Incidência de fungos filamentosos e perfil de micobiota ocratoxigênica em grãos de café (Coffea arabica L.) processados pelo método via-seca em Minas Gerais

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Resumo

Os fungos filamentosos quando associados à grãos de café, podem sob determinadas condições fisiológicas e ambientais ocasionar danos que refletem na qualidade, produzindo odores e sabores desagradáveis, além de favorecer a produção de micotoxinas. Este trabalho objetivou avaliar a diversidade de fungos filamentosos em grãos de café provenientes de cinco fazendas pertencentes ao estado de Minas Gerais, das mesorregiões Sul/ Sudoeste e Vale do Mucuri, além disso, buscou-se de e realizar a quantificação da produção de ocratoxina A por fungos potencialmente ocratoxigênicos. A identificação foi realizada com a junção de diferentes técnicas tais como: Avaliação morfológicas, MALDI TOF MS e sequenciamento das regiões ITS e β- tubulina. A quantificação de OTA dos isolados foi realizada por cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE). Foram isolados 389 fungos filamentosos e a identificação morfológica revelou seis gêneros de fungos: Aspergillus, Penicillium, Fusarium, Complexo Cladosporium cladosporioides, Alternaria e Eurotium. Os percentuais de contaminação variaram de 7 a 100% entre as amostras. No meio DRBC foram isolados 226 fungos filamentosos, equivalente a 58,09% do total de isolados. No meio DG18 foram isolados 163 fungos filamentosos, correspondendo a 41,90% do total de isolados. Apenas 5 isolados foram identificados por MALDI TOF MS, 2 a nível de gênero (Penicillium sp.) e 3 a nível de espécie: A. niger. Foram identificados por sequenciamento 24 isolados representantes, sendo 8 pertencentes ao gênero Penicillium e 16 à Aspergillus, 22 foram identificados a nível de espécie e 2 a nível de gênero. 41,88% dos isolados produziram OTA. Aspergillus Seção Nigri foram mais frequentes, correspondendo a 90,58% do total de isolados potencialmente ocratoxigênicos, no entanto, apenas 39,5% produziram OTA. Os isolados de Aspergillus Seção Circumdati corresponderam a 10,42% dos isolados potencialmente ocratoxigênicos e 67% dos isolados foram produtores de OTA. Os cafés dos municípios de Itaipé e São Sebastião do Paraíso, apresentaram maior incidência de isolados produtores de OTA em concentrações elevadas. A presença de fungos toxigênicos não indica necessariamente a presença de OTA, mas indica um risco potencial.

Abstract

Filamentous fungi when associated with coffee beans, can under certain physiological and environmental conditions cause damage that reflects on quality, producing unpleasant odors and flavors, in addition to favoring the production of mycotoxins. This work aimed to evaluate the diversity of filamentous fungi in coffee beans from five farms belonging to the state of Minas Gerais, from the South / Southwest and Vale do Mucuri mesoregions, in addition, we sought to select ochratoxigenic fungi and perform the quantification of production ochratoxin A by these. The identification was performed with the combination of different techniques such as: morphological characteristics, MALDI TOF MS and sequencing of the ITS and β-tubulin regions. The quantification of OTA of the isolates was performed by high performance liquid chromatography (HPLC). 389 filamentous fungi were isolated and the morphological identification revealed six genera of fungi: Aspergillus, Penicillium, Fusarium, Cladosporium cladosporioides complex, Alternaria and Eurotium. The contamination percentages varied from 7 to 100% between samples. In the DRBC medium, 226 filamentous fungi were isolated, equivalent to 58.09% of the total isolates. In the DG18 medium, 163 filamentous fungi, corresponding to 41.90% of the total of isolated fungi. Only 5 isolates were identified by MALDI TOF MS, 2 at the genus level (Penicillium sp) and 3 at the species level: A. niger. 24 representative isolates were identified by sequencing, 8 belonging to the genus Penicillium and 16 to Aspergillus, 23 were identified at the species level and 2 at the gender level. 41.88% of the isolates produced OTA. Aspergillus Section Nigri were more frequent, corresponding to 90.58% of the total of potentially ochratoxigenic isolates, however, only 39.5% produced OTA. The isolates of the Circumdati Section, corresponded to 10.42% of the potentially ochratoxigenic isolates and 67% of the isolates were OTA producers. The coffees from the municipalities of Itaipé and São Sebastião do Paraíso had a higher incidence of isolates producing OTA in high concentrations. The presence of toxigenic fungi does not necessarily indicate the presence of OTA, but it does indicate a potential risk.

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ALMEIDA, L. N. de. Incidência de fungos filamentosos e perfil de micobiota ocratoxigênica em grãos de café (Coffea arabica L.) processados pelo método via-seca em Minas Gerais. 2020.70 p. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agrícola) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2020.

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