dissertação
Aplicação de modelos funcionais na seleção genômica ampla
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Universidade Federal de Lavras
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Departamento de Ciências Exatas
Programa de Pós-Graduação
Programa de Pós-Graduação em Estatística e Experimentação Agropecuária
Agência de fomento
Tipo de impacto
Áreas Temáticas da Extenção
Objetivos de Desenvolvimento Sustentável
Dados abertos
Resumo
Com o surgimento de marcadores de alta densidade SNPs, ao mesmo tempo em que surge um
grande avanço no que diz respeito ao aumento da capacidade preditiva dos modelos, agravaramse
os problemas de multicolinearidade e alta dimensionalidade dos modelos na seleção genômica,
gerando desafios estatísticos e computacionais. Objetivou-se neste trabalho propor um
método e verificar sua eficiência na seleção genômica usando modelos funcionais. Dessa forma,
propôs-se que os efeitos de um loco genético é função de sua respectiva localização no genoma.
Para verificar a palpabilidade do modelo, simulou-se 300 indivíduos a três populações F2, conforme
três herdabilidades (0,2; 0,5 e 0,8), em um total de 12150 marcadores SNPs, distribuídos
em dez grupos de ligação. O modelo proposto no presente estudo obteve destaque nos cenários
oligogênico e poligênico, e pode ser recomendado a estudos posteriores a dados reais e com
diversas arquiteturas genéticas para conclusões mais consistentes.
Abstract
Upon the emergence of high-density SNP markers, along with great advancements related to the
increase in the predictive ability of models, there have been problems of multicolinearity and
high dimensionality of models in genomic selections, causing many statistic and computational
challenges. This work aimed at proposing a method and checking its efficiency in genomic
selections with functional models. Thus, we suggest that the effects of a genetic locum is
a function of its respective genomic position. To verify the suitability of such models, we
simulated 300 individuals in three populations F2, according to three heritabilities (0.2; 0.5 and
0.8) in a total of 12150 SNP markers distributed into ten bond groups. The model proposed in
this study was successful with oligogenic and polygenic scenarios, therefore, further research
with real data and several genetic frames is recommended for more consistent conclusions.
Descrição
Área de concentração
Agência de desenvolvimento
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Marca
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Resumen
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Citação
MOURA, E. G. Aplicação de modelos funcionais na seleção genômica ampla. 2017. 54 p. Dissertação (Mestrado em Estatística e Experimentação Agropecuária)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2017.