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Caracterização molecular de cultivares de batata Solanum tuberosum L. utilizando marcadores RAPD e SSR
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UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
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Programa de Pós-Graduação
PPBV - Programa de Pós-graduação em Biotecnologia Vegetal
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Resumo
A introdução de novas cultivares de batata (Solanum tuberosum L.) tem sido uma estratégia adotada para aumentar a produtividade desta cultura. A batata apresenta base genética estreita, o que dificulta a identificação das cultivares por meio de marcadores morfológicos. Assim, há necessidade constante de utilizar métodos que possam identificar tais cultivares e avaliar a variabilidade genética em seu germoplasma. Este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar a divergência genética e identificar cultivares de batata por meio de marcadores RAPD e SSR. Foram avaliadas 16 cultivares, fornecidas pela Empresa Multiplanta Tecnologia Vegetal Ltda. O DNA genômico foi amplificado com primers RAPD e com pares de primers SSR e os respectivos fragmentos gerados foram analisados por eletroforese em géis de agarose ou poliacrilamida, dependendo do marcador. As distâncias genéticas foram obtidas pelo coeficiente de Jaccard e os agrupamentos foram realizados pelo método UPGMA. Adicionalmente, foram calculados os valores de PIC para os primers RAPD e SSR utilizados. Os 25 primers RAPD geraram 92 bandas polimórficas e os 20 pares de primers SSR produziram 136 bandas polimórficas, que foram suficientes para estabelecer a similaridade genética entre as cultivares em estudo. A análise de agrupamento produziu os dendogramas que permitiram uma distinção genética das cultivares. Os valores de PIC demonstraram o alto conteúdo informativo dos primers RAPD e SSR e, com a utilização de 6 primers RAPD e de 3 primers SSR, foi possível identificar todas as 16 cultivares analisadas neste estudo. Os marcadores RAPD e SSR foram adequados para estudos de diversidade genética e para a caracterização das cultivares de batata, confirmando o potencial das técnicas na análise de fingerprinting e na caracterização genética de cultivares de batata.
Abstract
The introduction of new cultivars of potato (Solanum tuberosum L.) has been an adopted strategy to increase the productivity of this culture. Potato presents narrow genetic base, what makes the identification of their cultivars using morphologic markers difficult. Thus, it is necessary to use methods that can identify them and evaluate their genetic variability in its germoplasm. This work was carried out to evaluate the genetic divergence and to identify potato cultivars, using RAPD and SSR markers. A total of 16 cultivars were evaluated, supplied by the Multiplanta Vegetal Technology Ltda company. The genomic DNA was amplified with RAPD primer and with pairs of SSR primers.The generated fragments were analyzed by agarose or polyacrylamide gel electrophoresis, depending on the marker. The genetic distances were gotten by Jaccard coefficient and the groupings were carried out using UPGMA method. Additionally, the values of PIC were calculated for used RAPD and SSR primers. The 25 RAPD primers generated 92 polymorphic bands and the 20 pairs of SSR primers produced 136 polymorphic bands, which were enough to establish the genetic similarity among studied cultivars. The grouping analysis produced the dendrograms that allowed a genetic distinction of cultivars. The values of PIC demonstrated high informative content of RAPD and SSR primers and, with the use of 6 RAPD and 3 SSR primers, it was possible to identify all the 16 analyzed cultivars. RAPD and SSR markers were adjusted for genetic diversity studies and the characterization of potato cultivars, confirming the potential of the techniques in the analysis of fingerprinting in the genetic characterization of potato cultivars.
Descrição
Área de concentração
Biotecnologia Vegetal
Agência de desenvolvimento
Palavra chave
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Procedência
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Resumen
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Citação
ROCHA, Elizângela Almeida; PAIVA, Luciano Vilela (Orient.). Caracterização molecular de cultivares de batata (Solanum tuberosum L.) utilizando marcadores RAPD e SSR. 2008. vii, 87 p. Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal de Lavras, 2008.