tese
Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto
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Universidade Federal de Lavras
Faculdade, Instituto ou Escola
Departamento
Departamento de Biologia
Programa de Pós-Graduação
Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas
Agência de fomento
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Tipo de impacto
Áreas Temáticas da Extenção
Objetivos de Desenvolvimento Sustentável
Dados abertos
Resumo
Objetivou-se, neste trabalho, avaliar a viabilidade da aplicação da
seleção genômica ampla (GWS), no melhoramento do eucalipto. Para tanto,
foram empregados marcadores SNPs e DArTs na seleção precoce de uma
população representativa do programa de melhoramento da empresa Fibria S.A.
A população foi composta de híbridos, derivados do cruzamento entre plantas
pré-selecionadas de E. grandis, E. urophylla, E. globulus e E. camaldulensis e
de alguns híbridos entre elas. As combinações híbridas foram feitas ao acaso,
gerando 68 combinações híbridas, envolvendo 45 genitores distintos e, ao final,
foram obtidos 611 indivíduos. Os dados fenotípicos foram coletados aos 24, 36 e
63 meses de idade, totalizando 20 características relacionadas ao volume e
qualidade da madeira, sendo que algumas delas foram mensuradas em mais de
uma idade. Estes indivíduos também foram genotipados, utilizando-se
marcadores SNPs e DArTs, totalizando 36.812 e 15.742 marcadores
polimórficos, respectivamente. As análises da GWS foram feitas pela
metodologia do RR-BLUP. Acurácias preditivas acima de 0,7 foram encontradas
para a maioria das características, para ambos marcadores. Acurácias de
validação da GWS foram 46% e 40% inferiores as da predição, em média, para
SNPs e DArTs, respectivamente, sendo elas altamente influenciadas pela
herdabilidade da característica e também da marca. SNPs e DArTs foram
equivalentes em termos de capacidade preditiva (acurácia).A GWS mostrou-se
eficiente para seleção precoce principalmente para as características
circunferência à altura do peito e altura total das plantas, para ambos
marcadores.
Abstract
This project aimed to access the feasibility of Genome Wide Selection
(GWS) on eucalypt breeding. For that, SNP and DArT markers were used for
the early selection of a representative population from Fibria S.A. The
population was composed from hybrids, derived from the mating of pre-selected
E. grandis, E. urophylla, E. globules and E. camaldulensis plants, and also some
interspecies hybrids. Matings were carried out randomly between 45 distinct
genitors, which generaed 68 hybrid combinations and 611 individuals.
Phenotypic data were collected at 24, 36 and 63 months old, for 20 traits related
to volume and wood quality. Some traits were measured at two or more ages.
Plants were also genotyped using SNP and DArT markers, totalizing 36,812 and
15,752 polymorphic markers, respectively. GWS analysis were carried out using
RR-BLUP methodology. Predictive accuracies of 0.7 and higher were found for
most characteristics, for both markers. In average, GWS validation accuracies
were 46% and 40% inferiors than the predictive ones, for SNPs and DArTs,
respectively. Validation accuracies were highly influenced by trait heritability
and also marker heritability. SNPs and DArTs were very similar for predictive
capacity (accuracy). GWS showed to be efficient for early selection, mainly for
traits related to circumference at breast height and plant height, for both markers.
Descrição
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Agência de desenvolvimento
Palavra chave
Marca
Objetivo
Procedência
Impacto da pesquisa
Resumen
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DOI
Citação
REZENDE, B. A. Seleção genômica ampla para volume e qualidade da madeira em eucalipto. 2015. 74 p. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2015.