dissertação
Identification and partial characterization of the flowering time gene ID1 in sugarcane
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Editor
Universidade Federal de Lavras
Faculdade, Instituto ou Escola
Escola de Ciências Agrárias de Lavras (ESAL)
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Departamento de Biologia (DBI)
Programa de Pós-Graduação
Programa de Pós-Graduação em Agronomia/Fisiologia Vegetal
Agência de fomento
Tipo de impacto
Áreas Temáticas da Extenção
Objetivos de Desenvolvimento Sustentável
Dados abertos
Resumo
Sugarcane is an important crop with C4 carbon metabolism, which makes this crop one of the most productive cultivated plants. Recently, it has gained more attention because of its potential use in biofuel productivity. Such fact has made Brazil one of the most promising countries in this field. The fact that sugarcane has one of the most complex genomes of cultivated plants is hampering the development of sugarcane genetics that could support breeding and crop improvement programs. Sugarcane belongs to Saccharum L genus, within Poaceae (Grass) family and Andropogonae tribe, which involves only polyploid species. After Genomic research, sugarcane genome has been studied and unravelled, but, still, more research needs to be developed due to sugarcane genome complexity. The aim of this research was to identify and analyse the expression of an orthologue of the maize ID1 gene in sugarcane. Maize ID1 has an important flowering time regulator in this species. In silico analysis showed five contigs and four singlets that might be putative ID sequences in sugarcane. The isolation of partial sequence of ScID1 suggests that it plays a role in flowering process. Expression analysis showed that this gene is only expressed in immature leaves of sugarcane and not expressed in the shoot apical meristem. The ScID1 protein may act as a transcription factor during flowering in sugarcane.
A cana de açúcar é uma importante cultura que apresenta o metabolismo C4, sendo uma das mais plantas cultivadas mais produtivas. Recentemente, ela tem ganhado mais atenção devido ao seu potencial como fonte para a produção de biocombustíveis. Tal fato elevou o Brasil a um dos países mais promissores no setor. Contudo, a cana de açúcar, também, possui um genoma complexo, o que tem dificultado o desenvolvimento de pesquisas na área da genética, o que poderia dar suporte a programas de melhoramento da cultura. A cana de açúcar pertence ao gênero Saccharum L genus, que está dentro da família Poaceae (Gramineae) e da tribo Andropogonae, que envolve somente espécies poliplóides. Após o advento da Genômica, o genoma da cana de açúcar tem sido desvendado, contudo, a complexidade de seu genoma tem sido confirmada em muitos aspectos. O objetivo desse trabalho de dissertação foi identificar e analisar o perfil de expressão de um ortólogo do gene ID1 de milho em cana de açúcar. ID1 de milho tem uma importante função de regulação do florescimento nessa espécie. Análises in silico demonstraram a presença de cinco contigs e quatro singlets, que são possíveis sequências ID em cana de açúcar. O isolamento da sequência parcial de ScID1 sugere que esse gene possivelmente age no processo de florescimento em cana de açúcar. Análises de expressão sugerem que esse gene é expresso somente em folhas imaturas. A proteína ScID1 pode agir como um fator de transcrição, controlando o processo de florescimento nessa espécie.
A cana de açúcar é uma importante cultura que apresenta o metabolismo C4, sendo uma das mais plantas cultivadas mais produtivas. Recentemente, ela tem ganhado mais atenção devido ao seu potencial como fonte para a produção de biocombustíveis. Tal fato elevou o Brasil a um dos países mais promissores no setor. Contudo, a cana de açúcar, também, possui um genoma complexo, o que tem dificultado o desenvolvimento de pesquisas na área da genética, o que poderia dar suporte a programas de melhoramento da cultura. A cana de açúcar pertence ao gênero Saccharum L genus, que está dentro da família Poaceae (Gramineae) e da tribo Andropogonae, que envolve somente espécies poliplóides. Após o advento da Genômica, o genoma da cana de açúcar tem sido desvendado, contudo, a complexidade de seu genoma tem sido confirmada em muitos aspectos. O objetivo desse trabalho de dissertação foi identificar e analisar o perfil de expressão de um ortólogo do gene ID1 de milho em cana de açúcar. ID1 de milho tem uma importante função de regulação do florescimento nessa espécie. Análises in silico demonstraram a presença de cinco contigs e quatro singlets, que são possíveis sequências ID em cana de açúcar. O isolamento da sequência parcial de ScID1 sugere que esse gene possivelmente age no processo de florescimento em cana de açúcar. Análises de expressão sugerem que esse gene é expresso somente em folhas imaturas. A proteína ScID1 pode agir como um fator de transcrição, controlando o processo de florescimento nessa espécie.
Abstract
Descrição
Área de concentração
Fisiologia Vegetal
Agência de desenvolvimento
Palavra chave
Marca
Objetivo
Procedência
Impacto da pesquisa
Resumen
ISBN
DOI
Citação
COELHO, C. P. Identification and partial characterization of the flowering time gene ID1 in sugarcane. 2010. 68 p. Dissertação (Mestrado em Fisiologia Vegetal) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2010.