dissertação
Transmissibilidade e análise do genoma da estirpe andina do Potato virus s (pvs) detectada no Brasil
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Notas
Data
Autores
Geraldino, Priscilla de Sousa
Orientadores
Editores
Coorientadores
Membros de banca
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Editor
Universidade Federal de Lavras
Faculdade, Instituto ou Escola
Escola de Ciências Agrárias de Lavras (ESAL)
Departamento
Departamento de Fitopatologia
Programa de Pós-Graduação
Programa de Pós-Graduação em Agronomia/Fitopatologia
Agência de fomento
Tipo de impacto
Áreas Temáticas da Extenção
Objetivos de Desenvolvimento Sustentável
Dados abertos
Resumo
Estudos moleculares preliminares realizados com a região da capa protéica do isolado da estirpe Andina do PVS (PVSA), denominado de BB-AND, detectado pela primeira vez no Brasil em 2007, mostraram que este possui características diferentes dos outros já descritos em diferentes regiões do mundo. Nesse trabalho deu-se continuidade a esses estudos, avaliando-se a eficiência de transmissão desse isolado pelos afídeos Myzus persicae e Aphis gossypii e realizando-se o sequenciamento completo do seu genoma. Quando plantas de Chenopodium quinoa foram doadoras do inóculo, o BB-AND foi transmitido pelo M. persicae para 46,6% das plantas da mesma espécie e para 20% das plantas de batata. Por outro lado, esse vetor transmitiu o vírus para 10% das plantas de batata e 11% das plantas de C. quinoa, nos testes em que as plantas de batata foram empregadas como doadoras. O afídeo Aphis gossypii não transmitiu o BB-AND de plantas de batata para batata, apenas de batata para 3% das plantas de C.quinoa inoculadas. A transmissão foi maior quando a planta doadora foi C.quinoa, 3% das plantas de batata e 13,3% das plantas de C. quinoa inoculadas. Foram sequenciados 2810 nucleotídeos no terminal 5´ do genoma viral, e 4712 no terminal 3´, faltando o fragmento intermediário com 970pb. Considerando-se o fragmento da região 5´ com 2810 nt, a identidade com os demais isolados do banco de dados variou de 75 e 76% enquanto que a identidade dos nucleotídeos do fragmento com 4712pb, variou de 81 a 85%. Analisando-se a região codificadora, identidade da sequência da região 5´ ORF1 (RdRp) com os isolados de PVSA foi de 75 a 80%. Na outra extremidade a identidade variou de 81 a 89%. As três ORFs seguintes, componentes do bloco triplo, apresentaram identidades semelhantes, de 82 a 90% quando comparadas com os outros isolados de PVSA, e de 81 a 86% com os isolados comuns.A região da capa protéica mostrou identidades de 79 a 100% com os isolados andinos e 80 a 98% com os isolados comuns. A ORF 6 mostrou identidade de 81 a 89% com outros PVSA e de 80 a 82% com PVSO.Considerando-se as árvores baseadas nas sequências de aminoácidos e nucleotídeos, os isolados Andinos tenderam a se agrupar separadamente dos isolados comuns, entretanto o BB-AND sempre mostrou certa distância dos demais, mostrando uma clara distinção dos isolados Andinos disponíveis no GenBank.
Abstract
Descrição
Área de concentração
Fitopatologia
Agência de desenvolvimento
Palavra chave
Marca
Objetivo
Procedência
Impacto da pesquisa
Resumen
Palavras-chave
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DOI
Citação
GERALDINO, P. de S. Transmissibilidade e análise do genoma da estirpe andina do Potato virus S (PVS) detectada no Brasil. 2009. 45 p. Dissertação (Mestrado em Agronomia)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2009.