dissertação
Expressão gênica diferencial por CDNA-RAPD entre cultivares de feijão inoculadas por Sclerotinia sclerotiorum
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Universidade Federal de Lavras
Faculdade, Instituto ou Escola
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Departamento de Biologia
Programa de Pós-Graduação
Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas
Agência de fomento
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
Tipo de impacto
Áreas Temáticas da Extenção
Objetivos de Desenvolvimento Sustentável
Dados abertos
Resumo
O conhecimento do perfil transcricional de genótipos sob tratamentos específicos tem sido
considerado como ferramenta de grande relevância para a compreensão molecular dos
patossistemas, visando o conhecimento da resistência. O feijão é uma das culturas mais
importantes da economia brasileira e suscetíveis a patógenos. O mofo branco é uma doença
fúngica causada pelo patógeno Sclerotinia sclerotiorum e possui capacidade de reduzir
drasticamente a produtividade do cultivo e, em condições favoráveis, essas perdas podem ser
irreversíveis. Por isso, este trabalho tentou compreender de forma direta e indiretamente a
ação do patógeno frente a cultura do feijão, e teve como objetivos: (i) avaliar ajustes de
diferentes protocolos de kits comerciais de extração de RNA Total utilizando hastes de feijão
inoculados com o patógeno Sclerotinia sclerotiorum e, (ii) verificar, pela técnica cDNARAPD, a existência de variabilidade de expressão, e obter informações acerca do
transcriptoma de cultivares suscetíveis e resistentes ao mofo branco, quando inoculadas pelo
agente patogênico. A utilização da técnica RAPD em material expresso, utilizando 57 primers
decâmeros, permitiu a visualização de amplificação de 255 locos, sendo que cerca de 136
destes, polimórficos, comprovando assim, a existência de variabilidade de expressão gênica
com a identificação de putativos locos de interesse, através das diferenças qualitativas e
quantitativas observadas entre os tratamentos inoculados e não inoculados, de ambas as
linhagens.
Abstract
The knowledge of the transcriptional profile of genotypes under specific treatments has been
considered as a tool of great relevance for the molecular understanding of the patossystems,
aiming the knowledge of the resistance. Beans are one of the most important crops of the
Brazilian economy and susceptible to pathogens. White mold, a fungal disease caused by the
pathogen Sclerotinia sclerotiorum, has the ability to drastically reduce crop yields, under
favorable conditions these losses may be irreversible. Therefore, this work tried to understand
directly and indirectly the action of the pathogen against the bean culture. Therefore, this
study aimed to: (i) evaluate adjustments of different protocols of commercial Total RNA
extraction kits using bean stems inoculated with the pathogen Sclerotinia sclerotiorum and,
(ii) verify, by the cDNA-RAPD technique, the existence of variability of expression, and to
obtain information about the transcriptome of susceptible and white mold resistant cultivars
when inoculated by the pathogen. The use of the RAPD technique in express material using
57 decamer primers allowed the visualization of amplification of 255 loci, with about 136 of
these polymorphic, thus proving the existence of variability of genetic expression, with the
identification of putative loci of interest , through the qualitative and quantitative differences
observed between the inoculated and uninoculated treatments of both strains.
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MIRANDA, R. N. de. Expressão gênica diferencial por CDNA-RAPD entre cultivares
de feijão inoculadas por Sclerotinia sclerotiorum. 2019. 79 p. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) – Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2019.
