tese
Emprego da simulação na escolha do número de indivíduos no método "bulk" no melhoramento de plantas autógamas
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UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS
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Programa de Pós-Graduação
DBI - Departamento de Biologia
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Dados abertos
Resumo
O bulk é um método de condução de populações segregantes de autógamas, que apresenta como principal limitação perdas de progênies durante a amostragem. Informações para entender e minimizar o efeito são escassas. Com isso, objetivo deste estudo foi determinar o efeito da amostragem e da seleção natural no método bulk em plantas autógamas. Para avaliar o efeito da amostragem e da seleção natural no bulk, foram realizadas simulações considerando populações segregantes F4: 5 e F4:6 e F24:25. Os efeitos no número médio, mínimo e máximo de locos favoráveis, da variância genética e do número de alelos favoráveis foram mensurados ao longo das 1000 simulações de cada configuração. As simulações consideraram diferentes herdabilidades, interações alélicas e número de locos. O efeito da amostragem foi avaliado com diferentes tamanhos de bulk foram 50, 200, 1000, 2000 e 5000 indivíduos. O efeito da seleção natural foi incorporado na simulação por meio do valor adaptativo dos indivíduos. Duas situações foram contempladas uma em que o valor adaptativo mínimo era igual a 0,20 e os indivíduos possuíam valores entre 0,20 e 1,0 e outra em que os indivíduos tinham o mesmo valor adaptativo. Na determinação do tamanho do bulk a herdabilidade do caráter deve ser considerada. O tamanho de bulk de 2000 indivíduos foi equivalente ao de 5000 indivíduos. Constatou-se que a seleção natural resulta em ganho com bulks superiores a 1000 indivíduos.
The bulk method to conduct segreganting populations presents as the main limitation the loss of progenies during sampling. Studies to undertand and minimize this limitation are scarce. This study aimed to verify the effect of sampling and natural selection on the bulk method in self-pollinated plants. Many configurations were simulated using the F4 and F24 generations and families F4:5, F4:6 e F24:25. The effects on the average, minimum and maximum numbers favorable of loci, the genetic variance and the number of favorables alleles were measurad throug 1000 simulations for each configuration. The simulations considered different heritabilities, allelic interactions and number of loci. The sampling effect was evaluated with different bulk size of 50, 200, 1000, 2000 e 5000 individuals. The effect of natural selection was incorporated in to the simulation using individuals´ adaptative value. Two situations were considered: first- the minimam adaptative value ranged from 20% to 100% of the number of individuals and second- the number of individuals was equal. It was concluded that to determine the number of individuals for the bulk method the heritability should be considered. The bulk size 2000 of individuals in the simulated conditions were equally efficient as 5000 individuals. Natural selection results in genetic gain only for bulks sizes over 1000 individuals.
The bulk method to conduct segreganting populations presents as the main limitation the loss of progenies during sampling. Studies to undertand and minimize this limitation are scarce. This study aimed to verify the effect of sampling and natural selection on the bulk method in self-pollinated plants. Many configurations were simulated using the F4 and F24 generations and families F4:5, F4:6 e F24:25. The effects on the average, minimum and maximum numbers favorable of loci, the genetic variance and the number of favorables alleles were measurad throug 1000 simulations for each configuration. The simulations considered different heritabilities, allelic interactions and number of loci. The sampling effect was evaluated with different bulk size of 50, 200, 1000, 2000 e 5000 individuals. The effect of natural selection was incorporated in to the simulation using individuals´ adaptative value. Two situations were considered: first- the minimam adaptative value ranged from 20% to 100% of the number of individuals and second- the number of individuals was equal. It was concluded that to determine the number of individuals for the bulk method the heritability should be considered. The bulk size 2000 of individuals in the simulated conditions were equally efficient as 5000 individuals. Natural selection results in genetic gain only for bulks sizes over 1000 individuals.
Abstract
Descrição
Área de concentração
Genética e Melhramento de Plantas
Agência de desenvolvimento
Palavra chave
Marca
Objetivo
Procedência
Impacto da pesquisa
Resumen
Palavras-chave
ISBN
DOI
Citação
SILVA, J. W. da. Emprego da simulação na escolha do número de indivíduos no método 'bulk' no melhoramento de plantas autógamas. 2009. 59 p. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas)-Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2009.