dissertação

Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e qPCR

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UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS

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Programa de Pós-Graduação

PPBV - Programa de Pós-graduação em Biotecnologia Vegetal

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Objetivos de Desenvolvimento Sustentável

Dados abertos

Resumo

A bananeira é uma planta tropical de grande importância econômica. Seu fruto é amplamente consumido em todo mundo e sua produção é de grande impacto social, pois fixa a mão de obra no campo e movimenta a economia local, gerando renda e empregos diretos e indiretos. A bananicultura enfrenta problemas em sua produção ligados aos fatores bióticos, sendo os mais danosos os causados por fungos, e também por fatores abióticos como ventos e déficit hídrico que também interferem no ciclo produtivo da bananeira causando prejuízos em sua produção. Sendo a segunda fruta mais produzida no mundo em 2008 com uma produção de 89.099.503 t (FAO, 2010), a banana apresenta diferentes graus de esterilidade, e isso dificulta os programas de melhoramento convencionais. Neste contexto, o emprego de técnicas de engenharia genética, destacando dentre elas a caracterização de promotores tecido-específicos, desponta como uma alternativa bastante viável, favorecendo a aplicação de técnicas mais refinadas da manipulação do genoma, como emprego da cisgenia que visa o manejo dos genes da própria espécie em questão. No presente trabalho, foi utilizado seqüências gênicas previamente selecionadas através de um virtual screening no banco de dados DATAmusa. Estas sequências permitiram desenhar primers que posteriormente foram submetidos a uma reação em cadeia da polimerase (PCR) utilizando cDNA obtidos do RNA extraído de sete diferentes tecidos de duas cultivares de bananeira, Grande Naine e Prata Anã afim de identifica-las no genoma da bananeira em caráter tecido-específico. Desta forma, identificando a seqüência gênica deduz-se a presença do promotor tecido específico, que a partir de sua caracterização, pode-se avançar pelas novas fronteiras conquistadas com a evolução da engenharia genética, como por exemplo, a cisgenia, que consiste na manipulação do próprio genoma do organismo em estudo.

Abstract

The banana tree is a tropical plant of great economical importance. Its fruit is worldwidely consumed and its production exerts a great social impact, for it keeps the labor on the field which steers the local economy, hence creating income through direct and indirect jobs. The banana crop has been facing many biotic problems mainly caused by fungi as well as by abiotic stress such as winds and drought. Such problems has affected the crops productive cycle thus reducing its production. Being the second most produced fruit in the world 2008, with a 89.099t yield (FAO, 2010), this species presents different degree of sterility which affects the conventional breeding programs. The employment of genetic engineering techniques could be used to solve such problems. Thus, the characterization of promoters that drives the specific tissue gene expression becomes of great importance, for it also allows the use of genes from the same species in a cisgenic approach. In the current work, gene sequences previously selected through virtual screening taken from DATAmusa gene bank, were analyzed. In order to study the promoter expression, these sequences allowed designing primers for PCR reactions having cDNA obtained from seven different tissues collected from Grande Naine and Prata Anã cultivars. Therefore once the tissue gene expression is characterized, we can identify powerful promoters for cisgenic approach.

Descrição

Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, área de concentração em Biotecnologia Vegetal, para obtenção do título de “Mestre”.

Área de concentração

Biotecnologia Vegetal

Linha de pesquisa

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SILVA, L. G. T. da. Caracterização de sequências potencialmente promotoras de expressão gênica caráter tecido-específica de bananeiras (Musa spp.) utilizando RT-PCR e QPCR. 2010. 70 p. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2010.

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