dissertação
Avaliação de particularidades moleculares da 'Folha Murcha Me' e outros Citrus sinensis (L.) Osbeck e desenvolvimento de marcadores SCAR
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Universidade Federal de Lavras
Faculdade, Instituto ou Escola
Escola de Ciências Agrárias de Lavras (ESAL)
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Departamento de Biologia (DBI)
Programa de Pós-Graduação
Programa de Pós-Graduação em Agronomia/Fisiologia Vegetal
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Dados abertos
Resumo
Dentre os Citrus sinensis (L.) Osbeck, a ´Folha Murcha Me´ apresenta frutos de ótima qualidade, folhas enroladas e maturação no período de entressafra, com forte demanda por laranjas. Presta-se também para a extração de sucos, podendo ser usada na diversificação para fins industriais, tornando-se necessário o conhecimento da origem de tal variedade. Marcadores moleculares RAPD são amplamente usados em estudos de biologia molecular e servem como ferramentas na análise de diversidade genética. Neste contexto, este trabalho foi realizado com os objetivos de estudar a diversidade genética entre as laranjeiras, por meio de marcadores RAPD e, paralelamente, identificar regiões amplificadas de DNA que sejam capazes de diferenciar as laranjeiras, seqüenciar essas regiões e utilizar essas seqüências para a construção de marcadores SCAR. Porcentagens de dissimilaridade foram obtidas por meio do software NTSYS. O número de bandas polimórficas com 17 primers RAPD foi eficiente para análise dos dados, gerando a marca de 28 fragmentos polimórficos, apresentando correlação de alta magnitude (r = 0,99). Com esse número de fragmentos, a soma dos quadrados dos desvios em relação às amostragens e o valor de estresse foram menores que 0,05 (0,0431), sugerindo alta consistência na associação das matrizes de dissimilaridades. A análise de agrupamento, realizada com o método UPGMA, produziu um dendrograma. Sugere-se a formação de dois grupos, um deles constituídos pelas laranjeiras ´Folha Murcha Me´, ´Valência Tardia´, ´Natal´, ´Pêra Rio´, ´Baía ME´ e ´Baía´. Os genótipos ´Folha Murcha Me´ e os mutantes de folhas normais são 100% similares. Outro grupo seria formado pelas laranjas ´Seleta´ 1 e 2 e pela ´Seleta x Cravo´. Um fragmento polimórfico foi transformando em SCAR. O marcador SCAR construído se mostrou eficiente, já que não ocorreu amplificação nos indivíduos ´Folha Murcha Me´ e mutantes da ´Folha Murcha Me´ e se mostrou eficaz amplificando a seqüência nos indivíduos, ´Valência Tardia´, ´Natal´, ´Pêra Rio´, ´Baía ME´, ´Baía´, ´Seleta´ 1 e 2 e pela ´Seleta x Cravo´. Portanto, ele pode ser usado na identificação de laranjeiras.
Dentre os Citrus sinensis (L.) Osbeck, a ´Folha Murcha Me´ apresenta frutos de ótima qualidade, folhas enroladas e maturação no período de entressafra, com forte demanda por laranjas. Presta-se também para a extração de sucos, podendo ser usada na diversificação para fins industriais, tornando-se necessário o conhecimento da origem de tal variedade. Marcadores moleculares RAPD são amplamente usados em estudos de biologia molecular e servem como ferramentas na análise de diversidade genética. Neste contexto, este trabalho foi realizado com os objetivos de estudar a diversidade genética entre as laranjeiras, por meio de marcadores RAPD e, paralelamente, identificar regiões amplificadas de DNA que sejam capazes de diferenciar as laranjeiras, seqüenciar essas regiões e utilizar essas seqüências para a construção de marcadores SCAR. Porcentagens de dissimilaridade foram obtidas por meio do software NTSYS. O número de bandas polimórficas com 17 primers RAPD foi eficiente para análise dos dados, gerando a marca de 28 fragmentos polimórficos, apresentando correlação de alta magnitude (r = 0,99). Com esse número de fragmentos, a soma dos quadrados dos desvios em relação às amostragens e o valor de estresse foram menores que 0,05 (0,0431), sugerindo alta consistência na associação das matrizes de dissimilaridades. A análise de agrupamento, realizada com o método UPGMA, produziu um dendrograma. Sugere-se a formação de dois grupos, um deles constituídos pelas laranjeiras ´Folha Murcha Me´, ´Valência Tardia´, ´Natal´, ´Pêra Rio´, ´Baía ME´ e ´Baía´. Os genótipos ´Folha Murcha Me´ e os mutantes de folhas normais são 100% similares. Outro grupo seria formado pelas laranjas ´Seleta´ 1 e 2 e pela ´Seleta x Cravo´. Um fragmento polimórfico foi transformando em SCAR. O marcador SCAR construído se mostrou eficiente, já que não ocorreu amplificação nos indivíduos ´Folha Murcha Me´ e mutantes da ´Folha Murcha Me´ e se mostrou eficaz amplificando a seqüência nos indivíduos, ´Valência Tardia´, ´Natal´, ´Pêra Rio´, ´Baía ME´, ´Baía´, ´Seleta´ 1 e 2 e pela ´Seleta x Cravo´. Portanto, ele pode ser usado na identificação de laranjeiras.
Dentre os Citrus sinensis (L.) Osbeck, a ´Folha Murcha Me´ apresenta frutos de ótima qualidade, folhas enroladas e maturação no período de entressafra, com forte demanda por laranjas. Presta-se também para a extração de sucos, podendo ser usada na diversificação para fins industriais, tornando-se necessário o conhecimento da origem de tal variedade. Marcadores moleculares RAPD são amplamente usados em estudos de biologia molecular e servem como ferramentas na análise de diversidade genética. Neste contexto, este trabalho foi realizado com os objetivos de estudar a diversidade genética entre as laranjeiras, por meio de marcadores RAPD e, paralelamente, identificar regiões amplificadas de DNA que sejam capazes de diferenciar as laranjeiras, seqüenciar essas regiões e utilizar essas seqüências para a construção de marcadores SCAR. Porcentagens de dissimilaridade foram obtidas por meio do software NTSYS. O número de bandas polimórficas com 17 primers RAPD foi eficiente para análise dos dados, gerando a marca de 28 fragmentos polimórficos, apresentando correlação de alta magnitude (r = 0,99). Com esse número de fragmentos, a soma dos quadrados dos desvios em relação às amostragens e o valor de estresse foram menores que 0,05 (0,0431), sugerindo alta consistência na associação das matrizes de dissimilaridades. A análise de agrupamento, realizada com o método UPGMA, produziu um dendrograma. Sugere-se a formação de dois grupos, um deles constituídos pelas laranjeiras ´Folha Murcha Me´, ´Valência Tardia´, ´Natal´, ´Pêra Rio´, ´Baía ME´ e ´Baía´. Os genótipos ´Folha Murcha Me´ e os mutantes de folhas normais são 100% similares. Outro grupo seria formado pelas laranjas ´Seleta´ 1 e 2 e pela ´Seleta x Cravo´. Um fragmento polimórfico foi transformando em SCAR. O marcador SCAR construído se mostrou eficiente, já que não ocorreu amplificação nos indivíduos ´Folha Murcha Me´ e mutantes da ´Folha Murcha Me´ e se mostrou eficaz amplificando a seqüência nos indivíduos, ´Valência Tardia´, ´Natal´, ´Pêra Rio´, ´Baía ME´, ´Baía´, ´Seleta´ 1 e 2 e pela ´Seleta x Cravo´. Portanto, ele pode ser usado na identificação de laranjeiras.
Abstract
Descrição
Área de concentração
Fisiologia Vegetal
Linha de pesquisa
Agência de desenvolvimento
Palavra chave
Marca
Objetivo
Procedência
Impacto da pesquisa
Resumen
Palavras-chave
ISBN
DOI
Citação
CARVALHO, H. H. de. Avaliações de particularidades moleculares da 'Folha Murcha Me' e outros Citrus sinensis (L.) Osbeck e desenvolvimento de marcador SCAR. 2008. 76 p. Dissertação (Mestrado em Fisiologia Vegetal)–Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2008.