Avaliação de particularidades moleculares da 'Folha Murcha Me' e outros Citrus sinensis (L.) Osbeck e desenvolvimento de marcadores SCAR

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dc.contributor.advisor1Paiva, Luciano Vilela
dc.contributor.referee1Chalfun Júnior, Antônio
dc.contributor.referee1Souza, Maurício de
dc.creatorCarvalho, Humberto Henrique de
dc.date.accessioned2014-08-04T19:24:45Z
dc.date.available2014-08-04T19:24:45Z
dc.date.issued2014-08-04
dc.date.submitted2008-02-21
dc.description.concentrationFisiologia Vegetalpt_BR
dc.description.resumoDentre os Citrus sinensis (L.) Osbeck, a ´Folha Murcha Me´ apresenta frutos de ótima qualidade, folhas enroladas e maturação no período de entressafra, com forte demanda por laranjas. Presta-se também para a extração de sucos, podendo ser usada na diversificação para fins industriais, tornando-se necessário o conhecimento da origem de tal variedade. Marcadores moleculares RAPD são amplamente usados em estudos de biologia molecular e servem como ferramentas na análise de diversidade genética. Neste contexto, este trabalho foi realizado com os objetivos de estudar a diversidade genética entre as laranjeiras, por meio de marcadores RAPD e, paralelamente, identificar regiões amplificadas de DNA que sejam capazes de diferenciar as laranjeiras, seqüenciar essas regiões e utilizar essas seqüências para a construção de marcadores SCAR. Porcentagens de dissimilaridade foram obtidas por meio do software NTSYS. O número de bandas polimórficas com 17 primers RAPD foi eficiente para análise dos dados, gerando a marca de 28 fragmentos polimórficos, apresentando correlação de alta magnitude (r = 0,99). Com esse número de fragmentos, a soma dos quadrados dos desvios em relação às amostragens e o valor de estresse foram menores que 0,05 (0,0431), sugerindo alta consistência na associação das matrizes de dissimilaridades. A análise de agrupamento, realizada com o método UPGMA, produziu um dendrograma. Sugere-se a formação de dois grupos, um deles constituídos pelas laranjeiras ´Folha Murcha Me´, ´Valência Tardia´, ´Natal´, ´Pêra Rio´, ´Baía ME´ e ´Baía´. Os genótipos ´Folha Murcha Me´ e os mutantes de folhas normais são 100% similares. Outro grupo seria formado pelas laranjas ´Seleta´ 1 e 2 e pela ´Seleta x Cravo´. Um fragmento polimórfico foi transformando em SCAR. O marcador SCAR construído se mostrou eficiente, já que não ocorreu amplificação nos indivíduos ´Folha Murcha Me´ e mutantes da ´Folha Murcha Me´ e se mostrou eficaz amplificando a seqüência nos indivíduos, ´Valência Tardia´, ´Natal´, ´Pêra Rio´, ´Baía ME´, ´Baía´, ´Seleta´ 1 e 2 e pela ´Seleta x Cravo´. Portanto, ele pode ser usado na identificação de laranjeiras.pt_BR
dc.description.resumoDentre os Citrus sinensis (L.) Osbeck, a ´Folha Murcha Me´ apresenta frutos de ótima qualidade, folhas enroladas e maturação no período de entressafra, com forte demanda por laranjas. Presta-se também para a extração de sucos, podendo ser usada na diversificação para fins industriais, tornando-se necessário o conhecimento da origem de tal variedade. Marcadores moleculares RAPD são amplamente usados em estudos de biologia molecular e servem como ferramentas na análise de diversidade genética. Neste contexto, este trabalho foi realizado com os objetivos de estudar a diversidade genética entre as laranjeiras, por meio de marcadores RAPD e, paralelamente, identificar regiões amplificadas de DNA que sejam capazes de diferenciar as laranjeiras, seqüenciar essas regiões e utilizar essas seqüências para a construção de marcadores SCAR. Porcentagens de dissimilaridade foram obtidas por meio do software NTSYS. O número de bandas polimórficas com 17 primers RAPD foi eficiente para análise dos dados, gerando a marca de 28 fragmentos polimórficos, apresentando correlação de alta magnitude (r = 0,99). Com esse número de fragmentos, a soma dos quadrados dos desvios em relação às amostragens e o valor de estresse foram menores que 0,05 (0,0431), sugerindo alta consistência na associação das matrizes de dissimilaridades. A análise de agrupamento, realizada com o método UPGMA, produziu um dendrograma. Sugere-se a formação de dois grupos, um deles constituídos pelas laranjeiras ´Folha Murcha Me´, ´Valência Tardia´, ´Natal´, ´Pêra Rio´, ´Baía ME´ e ´Baía´. Os genótipos ´Folha Murcha Me´ e os mutantes de folhas normais são 100% similares. Outro grupo seria formado pelas laranjas ´Seleta´ 1 e 2 e pela ´Seleta x Cravo´. Um fragmento polimórfico foi transformando em SCAR. O marcador SCAR construído se mostrou eficiente, já que não ocorreu amplificação nos indivíduos ´Folha Murcha Me´ e mutantes da ´Folha Murcha Me´ e se mostrou eficaz amplificando a seqüência nos indivíduos, ´Valência Tardia´, ´Natal´, ´Pêra Rio´, ´Baía ME´, ´Baía´, ´Seleta´ 1 e 2 e pela ´Seleta x Cravo´. Portanto, ele pode ser usado na identificação de laranjeiras.pt_BR
dc.identifier.citationCARVALHO, H. H. de. Avaliações de particularidades moleculares da 'Folha Murcha Me' e outros Citrus sinensis (L.) Osbeck e desenvolvimento de marcador SCAR. 2008. 76 p. Dissertação (Mestrado em Fisiologia Vegetal)–Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2008.pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufla.br/handle/1/2132
dc.languagept_BRpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Lavraspt_BR
dc.publisher.collegeEscola de Ciências Agrárias de Lavras (ESAL)
dc.publisher.countryBRASILpt_BR
dc.publisher.departmentDepartamento de Biologia (DBI)pt_BR
dc.publisher.initialsUFLApt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Agronomia/Fisiologia Vegetalpt_BR
dc.rightsacesso abertopt_BR
dc.subjectLaranjeirapt_BR
dc.subjectRAPDpt_BR
dc.subjectDissimilaridade genéticapt_BR
dc.subject.cnpqCiências Agráriaspt_BR
dc.titleAvaliação de particularidades moleculares da 'Folha Murcha Me' e outros Citrus sinensis (L.) Osbeck e desenvolvimento de marcadores SCARpt_BR
dc.title.alternativeEvaluation of molecular particularitities of the "Folha Murcha Me" and others Citrus sinensis (L.) Osbeck and development of SCAR markerpt_BR
dc.typedissertaçãopt_BR

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