Agrupamento heterótico de milho usando marcadores SNPS
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Notas
Data
Autores
Oliveira, Lander Santos de
Orientadores
Pereira, Welison Andrade
Editores
Coorientadores
Membros de banca
Pereira, Welison Andrade
Pulcinelli, Carlos Eduardo
Schuster, Ivan
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Editor
Universidade Federal de Lavras
Faculdade, Instituto ou Escola
Departamento
Departamento de Biologia
Programa de Pós-Graduação
Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas
Agência de fomento
LongPing High-Tech
Tipo de impacto
Áreas Temáticas da Extenção
Objetivos de Desenvolvimento Sustentável
Dados abertos
Resumo
Os avanços das tecnologias de genotipagem têm transformado a forma com a qual os
programas de melhoramento gerenciam seus recursos genéticos. A identificação de
polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) pode beneficiar o entendimento da
diversidade genética entre linhagens de milho (Zea mays) e sua subsequente
classificação em grupos heteróticos, contribuindo na orientação de cruzamentos para
obtenção de híbridos com elevado desempenho. Neste contexto, o objetivo deste
trabalho consistiu em agrupar linhagens de milho em grupos, tendo como base os
dados oriundos de genotipagem por SNPs. Assim, neste estudo, a diversidade
genética de 293 genótipos foi investigada com 5252 SNPs. A partir dos resultados,
verificou-se que a distribuição média dos SNPs foi de 525 por cromossomo. O
conteúdo de informação polimórfica (PIC) apresentou média de 0,297. Com base na
matriz de distâncias genéticas, os indivíduos foram agrupados conforme o método
hierárquico das médias aritméticas não ponderadas (UPGMA) e a análise dos
componentes principais (PCA), revelando grupos similares, com alto índice de
correlação cofenética (0.953 and 0.863, respectivamente). Os resultados
demonstraram consistência quando comparados com grupos heteróticos previamente
estabelecidos com informações de genealogia e topcrosses. Além disso, subgrupos
foram revelados dentro de cada grupo, permitindo uma exploração mais aprofundada
da variabilidade genética dentre os materiais.
Abstract
The advances in genotyping technologies have transformed the way breeding
programs manage their genetic resources. The identification of single nucleotide
polymorphisms (SNPs) can improve the understanding of genetic diversity among
maize (Zea mays) inbred lines and their classification into heterotic groups, which is
useful to guide certain crosses to generate hybrids with higher performance. The
objective of this study was to classify maize inbred lines into groups with genotyping
data. Genetic diversity of 293 genotypes was investigated with 5252 SNPs. The
results showed that the SNPs distribution averaged 525 per chromosome.
Polymorphism information content (PIC) averaged 0.297. The unweighted pair group
method with arithmetic mean analysis (UPGMA) and principal component analysis
(PCA) based on a genetic distance matrix revealed similar clusters with high
cophenetic correlation coefficients (0.953 and 0.863, respectively). The results
demonstrated consistency compared to previously established heterotic groups using
pedigree and breeding information, and also allowed further exploration of genetic
variability by revealing subgroups within each group.
Descrição
Área de concentração
Agência de desenvolvimento
Palavra chave
Marca
Objetivo
Procedência
Impacto da pesquisa
Resumen
ISBN
DOI
Citação
OLIVEIRA, L. S. de. Agrupamento heterótico de milho usando marcadores SNPS. 2020. 40 p. Dissertação (Mestrado Profissional em Genética e Melhoramento de Plantas) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2020.