Agrupamento heterótico de milho usando marcadores SNPS

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dc.contributor.advisor-co1Schuster, Ivan
dc.contributor.advisor1Pereira, Welison Andrade
dc.contributor.referee1Pereira, Welison Andrade
dc.contributor.referee2Pulcinelli, Carlos Eduardo
dc.contributor.referee3Schuster, Ivan
dc.creatorOliveira, Lander Santos de
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/0380778426553587pt_BR
dc.date.accessioned2020-09-15T17:01:49Z
dc.date.available2020-09-15T17:01:49Z
dc.date.issued2020-09-15
dc.date.submitted2020-07-31
dc.description.abstractThe advances in genotyping technologies have transformed the way breeding programs manage their genetic resources. The identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs) can improve the understanding of genetic diversity among maize (Zea mays) inbred lines and their classification into heterotic groups, which is useful to guide certain crosses to generate hybrids with higher performance. The objective of this study was to classify maize inbred lines into groups with genotyping data. Genetic diversity of 293 genotypes was investigated with 5252 SNPs. The results showed that the SNPs distribution averaged 525 per chromosome. Polymorphism information content (PIC) averaged 0.297. The unweighted pair group method with arithmetic mean analysis (UPGMA) and principal component analysis (PCA) based on a genetic distance matrix revealed similar clusters with high cophenetic correlation coefficients (0.953 and 0.863, respectively). The results demonstrated consistency compared to previously established heterotic groups using pedigree and breeding information, and also allowed further exploration of genetic variability by revealing subgroups within each group.pt_BR
dc.description.resumoOs avanços das tecnologias de genotipagem têm transformado a forma com a qual os programas de melhoramento gerenciam seus recursos genéticos. A identificação de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) pode beneficiar o entendimento da diversidade genética entre linhagens de milho (Zea mays) e sua subsequente classificação em grupos heteróticos, contribuindo na orientação de cruzamentos para obtenção de híbridos com elevado desempenho. Neste contexto, o objetivo deste trabalho consistiu em agrupar linhagens de milho em grupos, tendo como base os dados oriundos de genotipagem por SNPs. Assim, neste estudo, a diversidade genética de 293 genótipos foi investigada com 5252 SNPs. A partir dos resultados, verificou-se que a distribuição média dos SNPs foi de 525 por cromossomo. O conteúdo de informação polimórfica (PIC) apresentou média de 0,297. Com base na matriz de distâncias genéticas, os indivíduos foram agrupados conforme o método hierárquico das médias aritméticas não ponderadas (UPGMA) e a análise dos componentes principais (PCA), revelando grupos similares, com alto índice de correlação cofenética (0.953 and 0.863, respectivamente). Os resultados demonstraram consistência quando comparados com grupos heteróticos previamente estabelecidos com informações de genealogia e topcrosses. Além disso, subgrupos foram revelados dentro de cada grupo, permitindo uma exploração mais aprofundada da variabilidade genética dentre os materiais.pt_BR
dc.description.sponsorshipLongPing High-Techpt_BR
dc.identifier.citationOLIVEIRA, L. S. de. Agrupamento heterótico de milho usando marcadores SNPS. 2020. 40 p. Dissertação (Mestrado Profissional em Genética e Melhoramento de Plantas) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2020.pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufla.br/handle/1/43079
dc.languagept_BRpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Lavraspt_BR
dc.publisher.countrybrasilpt_BR
dc.publisher.departmentDepartamento de Biologiapt_BR
dc.publisher.initialsUFLApt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantaspt_BR
dc.rightsOpenAccesspt_BR
dc.subjectDiversidade genéticapt_BR
dc.subjectPolimorfismos de nucleotídeo únicopt_BR
dc.subjectZea mayspt_BR
dc.subjectGenetic diversitypt_BR
dc.subjectSingle Nucleotide Polymorphism (SNP)pt_BR
dc.subjectMilhopt_BR
dc.subject.cnpqCiências Biológicaspt_BR
dc.titleAgrupamento heterótico de milho usando marcadores SNPSpt_BR
dc.title.alternativeHeterotic grouping of maize using SNP markerspt_BR

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