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http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/28287| Title: | Cadeia de Markov com estados latentes com aplicação em análises de seqüências de DNA |
| Other Titles: | Hidden Markov Chain with applicatíon in DNA sequence analysi |
| Authors: | Chaves, Lucas Monteiro Silva, Cibele Queiroz da Sáfedi, Thelma |
| Keywords: | Modelo de Markov Análise sequencial Estatística Biologia molecular |
| Issue Date: | 18-Dec-2017 |
| Publisher: | Universidade Federal de Lavras |
| Citation: | OLIVEIRA, D. C. de. Cadeia de Markov com estados latentes com aplicação em análises de seqüências de DNA. 2005. 180 p. Dissertação (Mestrado em Estatística e Experimentação Agropecuária) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, 2005. |
| Abstract: | Hidden Markov models (HMM's) are applied to locate segments with homogeneous C+G proportions (DNA sequence segmentation). The HMM's are showed in a didactic way and the methods ofan extended model are obtained. The isMalgorithm is used to obtain maximum-likehood estimators ofHMM's. A software that implement some HMMs methods was developed and applied to sequences fragments from Xylella fastidiosa, Escherichia coli, Streptococcus pneumoniae, Xanthomonas axonopodis pv. citri, and the complete genome of bacteriophage lambda. The results are discussed and compared with the research ofChurchill (1989) and da Silva (2003). |
| Description: | Esta dissertação/tese está disponível online com base na Resolução CEPE nº 090, de 24 de março de 2015, disponível em http://www.biblioteca.ufla.br/wordpress/wp-content/uploads/res090-2015.pdf, que dispõe sobre a disponibilização da coleção retrospectiva de teses e dissertações online no Repositório Institucional da UFLA, sem autorização prévia dos autores. Parágrafo Único. Caberá ao autor ou orientador a solicitação de restrição quanto à divulgação de teses e dissertações com pedidos de patente ou qualquer embargo similar. Art. 5º A obra depositada no RIUFLA que tenha direitos autorais externos à Universidade Federal de Lavras poderá ser removida mediante solicitação por escrito, exclusivamente do autor, encaminhada à Comissão Técnica da Biblioteca Universitária./ Arquivo gerado por meio da digitalização de material impresso. Alguns caracteres podem ter sido reconhecidos erroneamente. |
| URI: | http://repositorio.ufla.br/jspui/handle/1/28287 |
| Appears in Collections: | Estatística e Experimentação Agropecuária - Mestrado (Dissertações) |
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